【佳學(xué)基因檢測】腫瘤全基因組測序、單細(xì)胞測序以及揭示時(shí)空變化的Slide-DNA-SEQ

細(xì)胞的狀態(tài)和行為可能受到遺傳和環(huán)境因素的影響。特別是，腫瘤進(jìn)展由潛在的遺傳異常以及腫瘤微環(huán)境的構(gòu)成決定。量化這些因素的貢獻(xiàn)需要新的技術(shù)，能夠正確測量基因組序列的空間位置以及表型讀數(shù)。在這里，腫瘤基因解碼研究人員開發(fā)了slide DNA seq，一種從完整組織切片中捕獲空間分辨DNA序列的方法。創(chuàng)新的研究設(shè)計(jì)證明，這種方法正確地保留了局部腫瘤結(jié)構(gòu)，能夠從頭發(fā)現(xiàn)不同的腫瘤克隆及其拷貝數(shù)改變。佳學(xué)基因還可以們將載玻片DNA序列應(yīng)用于轉(zhuǎn)移的小鼠模型和原發(fā)性人類癌癥，揭示克隆種群局限于不同的空間區(qū)域。此外，通過與空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)的整合，可以發(fā)現(xiàn)與克隆特異性基因畸變、局部腫瘤微環(huán)境或兩者相關(guān)的不同基因集。總之，這種多模態(tài)空間基因組學(xué)方法提供了一個(gè)多功能平臺，用于量化細(xì)胞內(nèi)和細(xì)胞外因子如何影響基因表達(dá)、蛋白質(zhì)豐度和其他細(xì)胞表型。