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【佳學(xué)基因檢測】基因解碼技術(shù)體系之孟德爾隨機(jī)化

在基因檢測結(jié)果的正確性和全面性方面,另一種越來越頻繁地用于嚴(yán)格評估相關(guān)表型之間因果通路的設(shè)計(jì)是孟德爾隨機(jī)化 (MR)。孟德爾隨機(jī)化 (MR) 設(shè)計(jì)基于工具變量分析,該分析是在經(jīng)濟(jì)學(xué)中發(fā)

佳學(xué)基因檢測】基因解碼技術(shù)體系之孟德爾隨機(jī)化

 

在基因檢測結(jié)果的正確性和全面性方面,另一種越來越頻繁地用于嚴(yán)格評估相關(guān)表型之間因果通路的設(shè)計(jì)是孟德爾隨機(jī)化 (MR)。孟德爾隨機(jī)化 (MR) 設(shè)計(jì)基于工具變量分析,該分析是在經(jīng)濟(jì)學(xué)中發(fā)展起來的,被比作隨機(jī)對照試驗(yàn)。該設(shè)計(jì)基于這樣一種想法,即如果要假設(shè)兩個(gè)變量之間的因果關(guān)系(例如吸煙導(dǎo)致飲酒量增加),則研究該關(guān)系的簡單回歸分析將容易受到所有可能的混雜變量的影響。即使將已知的、相關(guān)的混雜變量作為協(xié)變量包括在分析中,仍然存在影響關(guān)系的未測量變量的可能性。然而,如果暴露變量(在這個(gè)例子中是吸煙)的代理可以被確定為隨機(jī)分布在人群中,因此沒有這些混淆,這將允許就因果關(guān)系做出更有力的結(jié)論。

根據(jù)佳學(xué)基因解碼,每一個(gè)從父母那里繼承的等位基因在減數(shù)分裂過程中是隨機(jī)分布的,所以遺傳變異可以代表這樣的代理,因?yàn)槿魏慰赡艿幕祀s因素都應(yīng)該在基因型中平均分布。因此,代理變量和結(jié)果變量之間的關(guān)聯(lián)提供了暴露變量是否與結(jié)果變量因果相關(guān)的無偏檢驗(yàn)。 例如,賊近的一項(xiàng)研究檢查了吸煙對體重指數(shù) (BMI) 的影響?;蚪獯a使用15 號染色體上CHRNA5-A3-B4基因簇中的 rs1051730 變體作為工具變量,因?yàn)樗c吸煙有密切關(guān)系(煙草和遺傳學(xué)聯(lián)盟,2010)。在樣本中,rs1051730 基因型與吸煙以及 BMI 相關(guān)。孟德爾隨機(jī)化 (MR) 的一個(gè)重要假設(shè)是工具變量(即基因型)僅通過暴露變量(即吸煙)影響結(jié)果變量(即 BMI),因此,多效性的存在(例如,rs1051730 影響兩者獨(dú)立的表型)將違反這一假設(shè)。為了評估這種可能性,作者按吸煙狀況對樣本進(jìn)行了分層,發(fā)現(xiàn) rs1051730 影響吸煙者的 BMI,但不影響非吸煙者。因此,rs1051730與吸煙沒有關(guān)系的BMI無關(guān),這為孟德爾隨機(jī)化 (MR)假設(shè)以及吸煙與BMI有因果關(guān)系的結(jié)論提供了支持。通過這種方式,孟德爾隨機(jī)化 (MR)研究有潛力對相關(guān)疾病之間的因果途徑進(jìn)行強(qiáng)有力的分析,從而對其共病提供見解。 應(yīng)該注意的是,孟德爾隨機(jī)化 (MR) 設(shè)計(jì)存在一些限制。賊重要的是,必須存在與所研究的因果變量密切相關(guān)的已知基因突變,此外,這種相關(guān)性越小,所需的樣本量就越大。

出于這個(gè)原因,多基因風(fēng)險(xiǎn)評分已被提議作為孟德爾隨機(jī)化中作為工具變量的個(gè)體變異的替代方案,這就是為什么在佳學(xué)基因解碼技術(shù)體系中進(jìn)行討論的原因。盡管如此,這會(huì)使評估孟德爾隨機(jī)化的假設(shè)變得更加困難,例如不存在多效性。已經(jīng)進(jìn)行了應(yīng)用于少量基因突變序列及位點(diǎn)的研究,但是孟德爾隨機(jī)化 (MR) 應(yīng)用中使用由數(shù)百甚至數(shù)千個(gè)基因檢測位點(diǎn)采用多基因風(fēng)險(xiǎn)評分的應(yīng)用還是有限的。對于物質(zhì)使用障礙,使用未暴露的個(gè)體(例如,非吸煙者)檢查遺傳風(fēng)險(xiǎn)和結(jié)果變量之間的關(guān)系可以作為多效性的測試,但類似的例子可能不適用于其他疾病。盡管如此,孟德爾隨機(jī)化 (MR) 應(yīng)用具有特別的前景,是基因解碼技術(shù)中用來更好地了解精神疾病合并癥的另一種重要方

 

孟德爾隨機(jī)化
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)
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