【佳學(xué)基因檢測(cè)】生殖障礙基因檢測(cè)中的20基因、138基因、384基因
與致病基因鑒定基因解碼有什么不同?
受檢者或者是醫(yī)生認(rèn)為:
20基因,138基因,384基因都是導(dǎo)致生殖障礙的一些常見(jiàn)或者已知的與生殖障礙明確相關(guān)的基因。但導(dǎo)致生殖障礙的基因不僅僅只有這些基因。例如,當(dāng)臨床認(rèn)知到20基因相關(guān)的時(shí)候,還有138基因(含20基因)也相關(guān)。隨著研究的深入,又發(fā)現(xiàn)有384個(gè)基因也相關(guān)。但隨著研究的深入,還會(huì)有更多的基因被發(fā)現(xiàn)相關(guān)。這些發(fā)現(xiàn)相關(guān)的信息意義就像密碼一樣需要去研究解開(kāi),佳學(xué)基因通過(guò)對(duì)相關(guān)基因信息全部檢測(cè)后,并結(jié)合自己的數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)相關(guān)基因可能導(dǎo)致疾病發(fā)生的信息進(jìn)行研究分析,得出因?yàn)橐阎蛐畔?shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)帶來(lái)的不足的問(wèn)題的研究結(jié)論。從而更全面正確的給出導(dǎo)致疾病發(fā)生的根本原因的基因信息。將檢測(cè)的基因數(shù)目明確下來(lái),限制了對(duì)疾病的分析和全面評(píng)估。
1、生殖障礙主要有哪些形式?
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:在這里講的20基因、138基因、384基因可能是基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)提供的生殖障礙基因檢測(cè)中的20基因,138基因或者384基因。但是,即使這里數(shù)目賊大的384個(gè)基因也并沒(méi)有包含可以產(chǎn)生生殖障礙的全部基因,更不用說(shuō)這里的20基因和138基因了。如果這里的20個(gè)基因、138個(gè)基因確實(shí)是生殖障礙有關(guān),那這些基因是不是常見(jiàn)、高頻的,這里需要打一個(gè)問(wèn)號(hào)?;蛟S從賊佳設(shè)計(jì)來(lái)說(shuō),數(shù)目越少,越應(yīng)當(dāng)選擇高頻基因。但是檢測(cè)單位是不是選擇高頻的,我們只能期待或者是希望、甚至是想當(dāng)然地認(rèn)為檢測(cè)設(shè)計(jì)單位是這樣設(shè)計(jì)的,但事實(shí)上是否如此,受檢者或者是大多數(shù)醫(yī)生是無(wú)法知道的。另外,這里的與生殖障礙有關(guān),到底是與什么有關(guān)?男性、女性是一樣的嗎?主要是檢查精子發(fā)育、還是卵泡發(fā)育?是檢查精子運(yùn)動(dòng)障礙,還是鞭毛異常還是卵泡活化。因?yàn)檫@其中任何一個(gè)單一的生殖障礙都會(huì)有超過(guò)400個(gè)以上的基因參與,當(dāng)所檢測(cè)的數(shù)量與實(shí)際可以引起的一大類疾病相關(guān)的眾多的基因相比的進(jìn)候,這里的常見(jiàn)的、已知明確的就變得含混和不明確了。
用數(shù)量、基因檢測(cè)包或者是基因組合或者是一組基因,首先就是檢測(cè)者為了滿足受檢者的價(jià)格要求,對(duì)測(cè)序、分析的基因進(jìn)行一個(gè)人為的限定。這是決定檢測(cè)結(jié)果是陰性還是陽(yáng)性的一個(gè)重要因素,而忽略了找出受檢者體內(nèi)的致病基因才是我們的核心關(guān)鍵目標(biāo)。同樣,這里所選擇的基因主要是來(lái)自于各種數(shù)據(jù)庫(kù),而跟受檢者體內(nèi)真正的致病基因沒(méi)有必然的關(guān)系。這是為什么,為了真正實(shí)現(xiàn)基因解碼,佳學(xué)基因堅(jiān)持至少要獲得全部外顯子的基因序列。
在沒(méi)有搞清楚患者的致病基因之前,先對(duì)患者的檢測(cè)范圍進(jìn)行限定,其依據(jù)是數(shù)據(jù)庫(kù),解讀也必然是數(shù)據(jù)庫(kù)。所以患者如果出現(xiàn):致病基因不是在選擇范圍之內(nèi)或者是突變位點(diǎn)沒(méi)有記錄在案。即使患者體內(nèi)存在致病基因突變。采用這些方法所得到的基因檢測(cè)結(jié)果也是陰性結(jié)果。只不過(guò)是所選擇的基因檢測(cè)數(shù)目越多,得到假陰性結(jié)果的可能性會(huì)稍微降低一些而已。
基因解碼在技術(shù)指標(biāo)上有兩個(gè)不同特點(diǎn),一是測(cè)定全部基因,二是用基于結(jié)構(gòu)的、功能與體內(nèi)生理過(guò)程的分析方法。這種技術(shù)體系一是避免人為選擇基因所造成的必然缺陷,二是突破數(shù)據(jù)庫(kù)的極限,極大程度地提高陽(yáng)性率、檢出率和臨床表現(xiàn)與基因變異之間的匹配度。
1、生殖障礙主要有哪些形式?
答:見(jiàn)佳學(xué)基因生殖基因突變及個(gè)性化解決方案圖譜。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:生殖障礙如果不加明確的說(shuō)明,或者是針對(duì)特定的患者,生殖障礙表現(xiàn)為男性不育癥、男性生殖力低下、男性生殖力過(guò)早喪失;女性不育癥、女性不孕癥、女性月經(jīng)周期、性生活異常,不排卵、少排卵、所排卵泡不能自然授精;授精卵早期不能進(jìn)行卵裂;也包括丈夫基因與妻子基因組合后形成的授精卵的各種異常,如授精卵著床、早期胚胎發(fā)育、幼兒胚胎發(fā)育過(guò)程、重要生理功能異常等。這中間任何一個(gè)環(huán)節(jié)出現(xiàn)問(wèn)題,都會(huì)引起臨床上表現(xiàn)的生殖障礙。
佳學(xué)基因各合作伙伴在2021年3月前得到的佳學(xué)基因生殖圖,重點(diǎn)描述了精子發(fā)育障礙部分。這只是生殖障礙中的極少的一部分疾病狀況。
2、生殖科醫(yī)生為什么要求患者做基因檢測(cè)?
答:臨床受孕的本質(zhì)是男女雙方提供的精子和卵子基因信息的融合過(guò)程。1.在融合的過(guò)程中受到外部環(huán)境和精子、卵子質(zhì)量等因素影響。而環(huán)境、質(zhì)量等本質(zhì)是蛋白是否均屬于正常導(dǎo)致,蛋白又受到基因控制和外部物理環(huán)境影響,因此需要做基因檢測(cè),來(lái)排查各項(xiàng)蛋白質(zhì)或者基因是否正常。2.精子,卵子各自信息融合中,也需要看通過(guò)基因檢測(cè)來(lái)看是否有壞的基因信息的融合可能。因此也需要基因檢測(cè)和基因信息的解碼分析。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:
不同的機(jī)構(gòu)以及不同的醫(yī)生對(duì)基因檢測(cè)的認(rèn)知和了解不同,基因測(cè)試的目的也互不相同。由于大多數(shù)基因檢測(cè)中能檢查數(shù)據(jù)庫(kù)已有的基因和位點(diǎn),而大多數(shù)病人的基因突變和基因位點(diǎn)沒(méi)有包含在數(shù)據(jù)庫(kù)中,因此大多數(shù)基因檢測(cè)公司通過(guò)基因檢測(cè)來(lái)驗(yàn)證患者是否存在已經(jīng)報(bào)道過(guò)的基因突變。如果是醫(yī)生的診斷得到明確的肯定,這時(shí)候,生殖科醫(yī)生推薦基因檢測(cè)的主要目的是輔助診斷。這是醫(yī)療機(jī)構(gòu)或者醫(yī)生所推薦基因檢測(cè)的主要目的。由于基因檢測(cè)在臨床應(yīng)用上的困境和廣泛存在的假陰性現(xiàn)象,很多生殖科的醫(yī)生不敢想象、也不知道基于基因信息可以明確疾病原因,預(yù)知嘗未演變有效的疾病,開(kāi)展獨(dú)立于臨床診斷的分子診斷過(guò)程。另外有相當(dāng)大部分基因檢測(cè)公司和項(xiàng)目,以檢測(cè)項(xiàng)目多、覆蓋客戶的興趣點(diǎn)為目標(biāo),所選擇的基因信息與疾病的發(fā)生或者是受檢者所關(guān)注的問(wèn)題的必然關(guān)系被忽視。這時(shí)候,基因檢測(cè)只能提示或提供非常狹小的信息。這主要用于風(fēng)險(xiǎn)提示或者是消費(fèi)級(jí)、娛樂(lè)級(jí)基因檢測(cè)。比較嚴(yán)謹(jǐn)?shù)?、水平比較高的生殖科大夫一般不會(huì)推薦推薦這種檢測(cè)。對(duì)基因了解不多的醫(yī)生有可能做出錯(cuò)誤推薦。有時(shí)候,醫(yī)生擔(dān)心患者對(duì)醫(yī)生進(jìn)行無(wú)形的脅迫、懷疑,再加上對(duì)低價(jià)格檢測(cè)的偏見(jiàn)好,會(huì)誘使醫(yī)生選擇這種水平上的檢測(cè),等待病人或者是受檢者認(rèn)知達(dá)到一定程度的時(shí)候,再推薦更具有臨床意義的基因檢測(cè)。
基因信息的本質(zhì)是可以對(duì)疾病的發(fā)生進(jìn)行獨(dú)立于臨床表征的判斷、找到每一個(gè)患者獨(dú)特的發(fā)病原因、根據(jù)發(fā)病原因明晰個(gè)性化的治療方案。這不僅是醫(yī)學(xué)的發(fā)展對(duì)基因信息提出的要求,也是正確的基因解碼對(duì)自己提出的標(biāo)準(zhǔn)。由此看來(lái),基因解碼是基因檢測(cè)的升級(jí)換代,是對(duì)傳統(tǒng)基因檢測(cè)的顛覆。但是可惜的是基因解碼的力量還不為大家所知,還不達(dá)被大家接受。只有在生殖科醫(yī)生充分認(rèn)識(shí)到基因解碼與基因檢測(cè)的不同時(shí),才會(huì)提升基因信息在臨床中的應(yīng)用目標(biāo)。從這個(gè)意義上講,佳學(xué)基因更好地介紹基因解碼,任重道遠(yuǎn)。而基因解碼的應(yīng)用空間和應(yīng)用價(jià)值遠(yuǎn)超我們和醫(yī)療界的認(rèn)知。
3、如果要找到致病基因,應(yīng)當(dāng)采用什么策略?
回答者:可行的策略是根據(jù)已知致病基因的比對(duì)以及可能的致病基因相關(guān)分析。也就是數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)和數(shù)據(jù)庫(kù)外基因相關(guān)性分析。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:對(duì)于一個(gè)出現(xiàn)生殖障礙的病人來(lái)說(shuō),要想快速有效的找到致病基因,為生育爭(zhēng)取時(shí)間、節(jié)省費(fèi)用。要堅(jiān)持兩個(gè)策略:(1)一是測(cè)定全部基因,而不是根據(jù)任何一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)選擇20基因、148基因或者是384基因。因?yàn)椴还苣氵x擇了一個(gè)多么便宜的基因,如果錯(cuò)過(guò)了真正的致病基因,這個(gè)選擇就是錯(cuò)誤的。更可怕的是真正的致病基因錯(cuò)過(guò)了,而檢測(cè)到的基因不是致病基因。這樣不僅浪費(fèi)了錢(qián),它還會(huì)耽擱一整代人,影響所有具有血緣關(guān)系的家庭。(2)二是,采用比數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)更為先進(jìn)的基因解碼分析法。雖然,基因解碼也還沒(méi)有達(dá)到先進(jìn)正確的地步,但它至少比其他基因公司采用的數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)方法的陽(yáng)性率提高了近一倍。而且可以產(chǎn)生獨(dú)立于臨床的分子診斷方案,進(jìn)一步地降低誤診和漏診。
4、做20基因、148基因和384個(gè)基因有什么優(yōu)缺點(diǎn)?
答:相關(guān)基因數(shù)越多分析得越全面。價(jià)格相對(duì)越高,少量基因檢測(cè)花費(fèi)成本更低。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:為具有不同購(gòu)買(mǎi)力的患者提供選擇以犧牲正確度為前提的低價(jià)檢測(cè);給患者一個(gè)選擇的可能性;給患者一個(gè)看起標(biāo)準(zhǔn)明確、似乎是賊好的選擇的可能性(384個(gè)基因)。通過(guò)降低醫(yī)生對(duì)先技科技學(xué)習(xí)掌握的障礙,促使醫(yī)生在穩(wěn)妥的水平上進(jìn)行基因檢測(cè)。其缺點(diǎn)是:進(jìn)一步強(qiáng)化了患者的致病基因在所圈定的范圍內(nèi)的錯(cuò)誤認(rèn)知,進(jìn)一步地傳播了數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的分析方法,而忽略了獲得全部突變,進(jìn)行基因解碼分析以解決問(wèn)題的臨床標(biāo)準(zhǔn)。
5、20基因、148基因和384個(gè)基因的基因檢測(cè)是采用什么技術(shù)做的?
答:每家公司運(yùn)用的檢測(cè)技術(shù)不一樣。具體詳見(jiàn)各公司檢驗(yàn)報(bào)告。目前較為先進(jìn)的檢測(cè)技術(shù)有:?jiǎn)畏肿訙y(cè)序技術(shù)和基于納米孔的測(cè)序技術(shù),454焦磷酸鈉測(cè)序,離子半導(dǎo)體測(cè)序等。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:20基因、148個(gè)基因和384個(gè)基因只是點(diǎn)明了該基因檢測(cè)中所設(shè)計(jì)的基因的數(shù)目,即沒(méi)有說(shuō)明每個(gè)基因是測(cè)定該基因的全長(zhǎng),也沒(méi)有說(shuō)明是測(cè)定了其中的一個(gè)片段。在很多基因檢測(cè)中,一個(gè)基因只測(cè)少量幾個(gè)位點(diǎn),有的甚至只測(cè)其中一個(gè)位點(diǎn)。因此,當(dāng)一個(gè)公司介紹自己的檢測(cè)項(xiàng)目,只介紹所測(cè)的基因數(shù)目,而沒(méi)有介紹檢測(cè)這個(gè)基因的范圍時(shí),是在檢測(cè)基因的信息范圍方面沒(méi)有有效說(shuō)清楚。所以20個(gè)基因的檢測(cè),或者是384個(gè)基因的檢測(cè)有可能采用的是PCR技術(shù)。這時(shí)候,一個(gè)PCR反應(yīng)只能檢測(cè)一個(gè)點(diǎn)或者是一個(gè)片段是否存在。也可能是采用的低密度芯片技術(shù),這時(shí)候,可能每一個(gè)基因只選擇了一兩個(gè)位點(diǎn)。如果采用高密度芯片進(jìn)行檢測(cè),鑒于高密度芯片中涵蓋有大量基因,這時(shí)候檢測(cè)公司只取其中的一部分信息,而每個(gè)基因只檢測(cè)了幾個(gè)位點(diǎn)。如果采用的是一代測(cè)序技術(shù),每一個(gè)基因只做了一個(gè)測(cè)序反應(yīng),也就是一個(gè)基因測(cè)了300-600個(gè)連續(xù)的位點(diǎn)。而每一個(gè)人的基因,一般是由不連續(xù)的片段組成,基本上都會(huì)有上萬(wàn)個(gè)基因。所以采用一代測(cè)序技術(shù),進(jìn)行生殖障礙基因檢測(cè),很有可能是沒(méi)有獲得全部基因信息。20基因、148基因和384基因的基因檢測(cè)為了高效先進(jìn)個(gè)質(zhì)量指標(biāo)也就是獲得基因信息的完整性,應(yīng)當(dāng)采用高通量測(cè)序技術(shù),而這個(gè)時(shí)候,不同的公司的質(zhì)量仍有差異,差異在于捕獲測(cè)序的探針及各種工藝流程,這些方面出問(wèn)題就更需要很深的技術(shù)功底了。而這里只講了獲取基因序列的方面,一個(gè)更重要的方面是,獲得序列后的是否有能力對(duì)突變進(jìn)行解讀。這里主要有兩種方法,一種是數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的方法,一種是基因解碼的方法。
6、不同的機(jī)構(gòu)都做20個(gè)基因、148個(gè)基因和384個(gè)基因的檢測(cè),檢測(cè)結(jié)果會(huì)都是一樣的嗎?
答:檢測(cè)結(jié)果一樣,但分析結(jié)果不一定一樣。因?yàn)槟壳皣?guó)內(nèi)的基因檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室每年都會(huì)對(duì)檢測(cè)結(jié)果校正,合格后實(shí)驗(yàn)室等檢驗(yàn)機(jī)構(gòu)才能對(duì)外開(kāi)展業(yè)務(wù)?;诿考夜镜男畔⒎治瞿芰Φ牟町?,因此對(duì)分析結(jié)果的理解不一樣。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:即使都叫20個(gè)基因的基因檢測(cè)、148個(gè)基因的基因檢測(cè)或者384個(gè)基因的基因檢測(cè),不同的公司采用測(cè)序方法不一樣,獲得DNA的序列不一樣,單是獲得的DNA序列信息都不一樣。因此,不同公司的檢測(cè)結(jié)果是不一樣的。這在消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè)、風(fēng)險(xiǎn)類基因檢測(cè)尤其如此。在臨床類基因檢測(cè)也有不同。但是如果參加了全國(guó)的質(zhì)量評(píng)估,檢測(cè)序列的范圍差別就不是主要因素。但是還有一個(gè)更重要的點(diǎn)是,針對(duì)患者的檢測(cè)不僅包含序列獲取,還包括有意義突變序列的判定和結(jié)果解讀。在這個(gè)階段主要有數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)法和基因解碼分析方法。所以即使都采用高通量測(cè)序,都獲得了全部基因序列,都獲得了所有突變,患者拿到的檢測(cè)報(bào)告的結(jié)論也是不一樣的。一般來(lái)說(shuō),基因解碼的檢出率更高、臨床特征和基因突變的匹配度更高。
7、做20個(gè)基因、148個(gè)基因和384個(gè)基因的檢測(cè),使用的技術(shù)都是一樣的嗎?可以采用哪些技術(shù)做包含這些數(shù)目的基因檢測(cè)?
答:詳見(jiàn)問(wèn)答5。目前采用高通量技術(shù)都可以完成檢測(cè)。具體提供結(jié)果看基因檢測(cè)公司提供的服務(wù)項(xiàng)目和服務(wù)優(yōu)勢(shì)領(lǐng)域等。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:即使都叫20個(gè)基因的基因檢測(cè)、148個(gè)基因的基因檢測(cè)或者384個(gè)基因的基因檢測(cè),不同的公司采用測(cè)序方法不一樣,獲得DNA的序列不一樣,單是獲得的DNA序列信息都不一樣。因此,不同公司的檢測(cè)結(jié)果是不一樣的。這在消費(fèi)級(jí)基因檢測(cè)、風(fēng)險(xiǎn)類基因檢測(cè)尤其如此。在臨床類基因檢測(cè)也有不同。但是如果參加了全國(guó)的質(zhì)量評(píng)估,檢測(cè)序列的范圍差別就不是主要因素。但是還有一個(gè)更重要的點(diǎn)是,針對(duì)患者的檢測(cè)不僅包含序列獲取,還包括有意義突變序列的判定和結(jié)果解讀。在這個(gè)階段主要有數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)法和基因解碼分析方法。所以即使都采用高通量測(cè)序,都獲得了全部基因序列,都獲得了所有突變,患者拿到的檢測(cè)報(bào)告的結(jié)論也是不一樣的。一般來(lái)說(shuō),基因解碼的檢出率更高、臨床特征和基因突變的匹配度更高。
8、為什么基因解碼技術(shù)支持下的檢測(cè),即使只做20個(gè)基因、148個(gè)基因和384個(gè)基因,也會(huì)得出更好的結(jié)果?
答:因?yàn)榛蚪獯a技術(shù)是檢測(cè)的全基因分析,已經(jīng)包含了以上基因檢測(cè)。相對(duì)于以上基因項(xiàng)目的檢測(cè),基因解碼檢測(cè)的更多基因,因此結(jié)果更好,更全面正確。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:基因解碼技術(shù)有兩個(gè)基本指標(biāo):一是測(cè)定全部基因序列,獲得全部突變,這個(gè)規(guī)定了獲取信息的全面性,而基因檢測(cè)技術(shù)是沒(méi)有這項(xiàng)規(guī)定的。不同的公司、不同的機(jī)構(gòu)可以根據(jù)自己的理解、根據(jù)市場(chǎng)價(jià)格及客戶的需求,有的甚至利用客戶和檢測(cè)機(jī)構(gòu)之間的信息不對(duì)稱,來(lái)改變檢測(cè)范圍。基因解碼的第二個(gè)質(zhì)量指標(biāo)是基因解碼分析法:一般的基因檢測(cè)采用的是數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的方法。目前世界上所有的數(shù)據(jù)庫(kù)只對(duì)不到十萬(wàn)分之一的突變進(jìn)行了注釋,因此,采用數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)的方法很有可能無(wú)法對(duì)患者出現(xiàn)的基因突變進(jìn)行正確的解讀。而基因解碼分析方法是基于人類組成成分的結(jié)構(gòu)功能分析法,可以解讀分析任何一個(gè)基因突變。因此,基因解碼分析法會(huì)得出更好的結(jié)果。
9、佳學(xué)基因有同樣價(jià)位的基因檢測(cè)項(xiàng)目嗎?
答:你是希望更好的解決問(wèn)題還是更在意因?yàn)閮r(jià)格差異而不關(guān)注結(jié)果。
佳學(xué)基因遺傳咨詢師:佳學(xué)基因的技術(shù)體系是對(duì)其他基因檢測(cè)項(xiàng)目和檢測(cè)技術(shù)的包含,因此佳學(xué)基因可以以同樣的價(jià)位提供其他基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)的檢測(cè)。但是佳學(xué)基因更多的是采用同樣的價(jià)位提供具有更高質(zhì)量的基因解碼。而基因解碼技術(shù)是由佳學(xué)基因系統(tǒng)的提出產(chǎn)并推廣的。