【佳學(xué)基因檢測(cè)】魚鱗病基因檢測(cè)需要到北京嗎?
魚鱗病基因檢測(cè)需要到北京嗎?
魚鱗?。↖chthyosis)是一種由多種基因突變引起的遺傳性皮膚病,其特征是皮膚干燥、粗糙和脫屑?;驒z測(cè)是確診和確定魚鱗病類型的重要手段。是否需要到北京進(jìn)行基因檢測(cè),取決于幾個(gè)因素:
1. 檢測(cè)機(jī)構(gòu)的分布
全國(guó)范圍的檢測(cè):許多遺傳檢測(cè)實(shí)驗(yàn)室在全國(guó)范圍內(nèi)提供魚鱗病的基因檢測(cè)服務(wù)。這些實(shí)驗(yàn)室可能在你所在城市或附近的城市就有。因此,進(jìn)行基因檢測(cè)不一定需要去北京。
北京的優(yōu)勢(shì):北京擁有一些頂尖的遺傳研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)院,比如北京協(xié)和醫(yī)院和中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院等,這些機(jī)構(gòu)提供先進(jìn)的基因檢測(cè)技術(shù)和遺傳咨詢服務(wù)。
2. 檢測(cè)服務(wù)的選擇
地方醫(yī)院和實(shí)驗(yàn)室:很多地方醫(yī)院和區(qū)域性實(shí)驗(yàn)室已經(jīng)能夠提供魚鱗病的基因檢測(cè)服務(wù)。你可以先咨詢當(dāng)?shù)氐钠つw科或遺傳科醫(yī)生,了解是否可以在本地進(jìn)行檢測(cè)。
在線檢測(cè)服務(wù):有些遺傳檢測(cè)公司提供郵寄樣本的檢測(cè)服務(wù),你可以在家中采集樣本并郵寄到指定的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行檢測(cè),無(wú)需到北京。
3. 特殊需求和綜合服務(wù)
專家咨詢:如果你需要專業(yè)的遺傳咨詢或者復(fù)雜病例的進(jìn)一步分析,去北京的頂級(jí)醫(yī)院可能會(huì)有更好的資源和專業(yè)人員。
個(gè)案分析:某些稀有類型的魚鱗病可能需要更專業(yè)的分析和研究,在這種情況下,頂級(jí)研究機(jī)構(gòu)和醫(yī)院可能提供更詳盡的服務(wù)。
4. 如何進(jìn)行基因檢測(cè)
咨詢醫(yī)生:首先,你應(yīng)該咨詢皮膚科或遺傳科醫(yī)生,他們可以幫助你決定是否需要基因檢測(cè),并推薦合適的檢測(cè)機(jī)構(gòu)。
選擇實(shí)驗(yàn)室:根據(jù)醫(yī)生的建議,選擇適合的實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行基因檢測(cè)。你可以選擇本地的醫(yī)院實(shí)驗(yàn)室,也可以選擇提供郵寄檢測(cè)服務(wù)的公司。
采樣和提交:按照實(shí)驗(yàn)室的要求進(jìn)行樣本采集和提交。
關(guān)于基因檢測(cè)機(jī)構(gòu)的共識(shí)性意見(jiàn)
你不一定需要到北京進(jìn)行魚鱗病基因檢測(cè)。可以選擇當(dāng)?shù)氐尼t(yī)院或?qū)嶒?yàn)室,或者利用提供郵寄服務(wù)的基因檢測(cè)公司。如果你需要特別的專家意見(jiàn)或有復(fù)雜的病例,去北京的頂級(jí)醫(yī)院可能會(huì)有額外的好處。
魚鱗病基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)臨床分析
魚鱗病的一個(gè)基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)臨床分析納入了 11 名具有 3 種表型的魚鱗病患者。其中 5 人屬于兩個(gè)近親家族:A(A3、A4 和 A7)和 F(F1 和 F2)。其他 6 例(C1、M1、B1、Y1、K1 和 E1)為散發(fā)病例(表?1)。
表1: 魚鱗病基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)分析所包括的魚鱗病患者的臨床特征、受影響的基因和新遺傳變異的特征
|
ID | A3 | A4 | A7 | F1 | F2 | C1 | M1 | B1 | Y1 | K1 | E1 |
患者的臨床診斷數(shù)據(jù) | 性別 | M | F | M | F | F | M | M | F | M | M | F |
診斷年齡* | 3 | 1 | 6 | 35 | 4 | 34 | 74 | 1 | 19 | 14 | 15 | |
火棉膠寶寶 | P | P | P | A | A | ND | P | P | P | P | A | |
板狀鱗片 | P | A | P | A | A | A | A | P | P | P | A | |
細(xì)鱗片 | A | P | A | P | P | P | P | A | A | A | P | |
刻度顏色 | 棕色 | 白色 | 黑色 | 棕色 | 棕色 | 白色 | 白色 | 棕色 | 黑色 | 棕色 | 白色 | |
紅斑 | P | P | A | P | A | P | P | A | P | A | P | |
眼瞼外翻 | P | P | A | A | A | A | P | P | P | A | A | |
脫發(fā) | A | A | A | A | A | A | P | A | A | A | A | |
棕櫚油 | P | A | P | A | A | 嚴(yán)重 | 嚴(yán)重 | P | P | P | P | |
偽阿因胡姆 | A | A | A | A | A | P | A | A | P | A | A | |
短指癥 | A | A | A | A | A | A | P | P | P | A | P | |
耳朵畸形 | A | A | A | A | A | A | A | P | P | A | A | |
褶皺受累 | P | A | P | A | Inguial | A | P | P | P | A | P | |
診斷 | CIE | CIE | LI | ILC | ILC | CIE | CIE | LI | LI | LI | CIE• | |
致病基因鑒定結(jié)果 | 受影響的基因 | NIPAL4 | NIPAL4 | NIPAL4 | ABCA12 | ABCA12 | NIPAL4 | TGM1 | TGM1 | TGM1 | CYP4F22 | CERS3 |
突變 | c.118C > TN | c.118C > TN | c.118C > TN | c.2855A > GN | c.2855A > GN | c.534A > CR | c.788G > AR | c.788G > AR | c.1042C > TR | c.844C > TR | c.(999 + 1_1000-1)_(*1_?)del | |
c.5898G > CN | c.5898G > CN | |||||||||||
狀態(tài) | H | H | H | H/H | H/H | H | H | H | H | H | H | |
文獻(xiàn)中的陳述 [參考] | – | – | – | – | – | H [46, 49] | H [42, 51] | H [42, 51] | C.het | C.het [30] | H [44] | |
C.het [52] | C.het [52] | [51, 53] | H [29] | |||||||||
外顯子 | 1 | 1 | 1 | 18; 37 | 18;37 | 4 | 5 | 5 | 7 | 8 | 13 | |
生物信息分析評(píng)分 (score) | PolyPhen2 | 0.808(+) | 0.808 (+) | 0.808(+) | 0.899(++) | 0.899(++) | 0.004(Φ) | – | – | – | 0.955(+) | – |
Sift | 0.036(#) | 0.036(#) | 0.036(#) | 0; 0.008(##) | 0; 0.008(##) | 0.03(#) | – | – | – | 0(##) | – | |
Mutation Taster | 0.995(ψ) | 0.995(ψ) | 0.995(ψ) | 1(ψ);0.999(ψψ) | 1(ψ);0.999(ψψ) | 0.999(ψψ) | 1(ψψ) | 1(ψψ) | 1(ψψ) | 0.999(ψψ) | – | |
Panther | 1629(++) | 1629(++) | 1629(++) | 1238(++) | 1238(++) | 1629(++) | – | – | – | 1038(++) | – | |
1237(++) | 1237(++) | |||||||||||
CADD | 23.5 | 23.5 | 23.5 | 28.4; 32 | 28.4; 32 | 28.5 | – | – | – | 23.9 | – | |
MAF(GnomAd) | A | A | A | A | A | A | 2.8E-05 | 2.8E-05 | 7.1E-06 | 1.2E-05 | A |
F女性;M男性;* 診斷年齡(歲);ND未確定;Palmo hyper掌跖角化過(guò)度癥;P存在;A缺失;LI板層狀魚鱗病;CIE先天性魚鱗病樣紅皮??;ILC曲折性線狀魚鱗??;CIE •伴有眼部缺損的 CIE,Del缺失;– 不存在;H純合;C.het復(fù)合雜合;(+)可能有害;(++)很可能有害;(#)有害;(##)有害;(ψ):多態(tài)性;(ψψ)致?。?Φ)良性,N新變異;R已報(bào)告變異;MAF次要等位基因頻率
A 家族的三名患者均為火棉膠嬰兒。隨著年齡的增長(zhǎng),A3 和 A4 逐漸發(fā)展為 CIE,而 A7 則發(fā)展為 LI?;颊?A4 一歲時(shí),皮膚檢查顯示全身有白色細(xì)鱗片,下層皮膚呈紅斑。她的兄弟(A3)在 3 歲時(shí)額頭和四肢出現(xiàn)較大的鱗片,而軀干上的鱗片細(xì)小且呈棕色,皮膚呈紅斑。然而,他們的堂兄(A7)患有 LI,全身鱗片顏色更深、更厚且呈板狀,沒(méi)有紅斑(圖 1a)。與 A7 和其他家庭成員相比,患有 CIE 的患者(A3 和 A4)頭發(fā)稀疏,呈淺棕色。特別是,A3 和 A7 的褶皺受到影響,而只有 A3 的腳底過(guò)度線性?;颊?A7 在 6 歲時(shí)患上彌漫性但不嚴(yán)重的足底角化病,而患者 A4 的手掌和腳底未受影響。
圖1:魚鱗病基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)中部分參與患者的臨床特征。a患者 A7 腋窩有深色、厚且呈板狀的鱗屑(NIPAL4);b患者 F1 軀干上有多環(huán)狀紅斑和鱗狀斑塊,伴有褐色細(xì)鱗屑(ABCA12);c患者 C1 右手手指有假性白斑(NIPAL4),d a 患者 C1 有淡黃色掌側(cè)角化?。∟IPAL4);e患者 M1 軀干皮膚有魚鱗病樣紅皮病,伴有細(xì)小的白色鱗屑(TGM1);f患者 Y1 面部和頸部有大片褐色板狀鱗屑,耳朵粘連(TGM1);g患者 Y1 的手有彌漫性掌側(cè)角化病和短指畸形(TGM1)
F家系包括2名患者(F1和F2)。先證者F1,35歲,其表型與其4歲女兒(F2)相似。兩名患者均表現(xiàn)為多發(fā)性多環(huán)紅斑和鱗狀斑塊,伴有褐色細(xì)小鱗屑(圖1b)患者F1的病變位于軀干,患者F2的病變位于前臂、肘部和腹股溝處。后者出生時(shí)患有皮膚干燥癥。兩名患者均無(wú)眼瞼外翻、脫發(fā)和耳畸形。
C1 患者,34 歲,患有 CIE,皮膚有輕度紅斑,褶皺處有小片白色鱗屑。手掌和腳掌出現(xiàn)嚴(yán)重的黃色角化病,伴有假性白斑,手指活動(dòng)受限(圖1c、d)四肢的這些方面與 Mal de Meleda 病的四肢非常相似。沒(méi)有眼瞼外翻,耳朵正常。
M1 患者,74 歲,也患有 CIE,出現(xiàn)輕度紅皮病,全身覆蓋細(xì)小的白色鱗片(圖1e)出生時(shí)為火棉膠嬰兒,后來(lái)出現(xiàn)雙側(cè)外翻和彌漫性掌跖角化?。≒PK)或掌跖過(guò)度線性。皺褶受累,脫發(fā)尤為明顯。還出現(xiàn)長(zhǎng)掌短指的短指癥。此外,M1 患者因反復(fù)感染而出現(xiàn)疼痛的掌裂和右手第二指和左手第三指遠(yuǎn)端指腹壞死。
而B1、Y1和K1為L(zhǎng)I表型。B1患者1歲,全身覆蓋棕色大片板狀鱗屑,無(wú)紅斑;Y1患者全身覆蓋黑色大片板狀鱗屑,包括皮膚皺褶處,紅斑。Y1面部和頸部有大片棕色板狀鱗屑,耳朵粘連(圖1f)雙手出現(xiàn)彌漫性手掌角化病(圖1g)兩名患者(B1 和 Y1)均為火棉膠嬰兒,后來(lái)出現(xiàn)雙側(cè)眼瞼外翻和彌漫性 PPK 或掌跖過(guò)度線性。兩名患者均出現(xiàn)皺褶和耳朵畸形。還發(fā)現(xiàn)有長(zhǎng)手掌和短手指的短指癥。14 歲的 K1 為火棉膠嬰兒,后來(lái)在前肢、軀干和四肢近端出現(xiàn)大片棕色鱗片。腿部和前臂的鱗片變小。沒(méi)有出現(xiàn)大皺褶。四肢有輕度掌跖角化癥和過(guò)度線性。未報(bào)告眼瞼外翻、指甲異常、脫發(fā)和耳朵畸形。
賊后,患有綜合性魚鱗?。–IE 伴眼部缺損)的 E1 患者出現(xiàn)輕微的皮膚紅斑。面部、軀干和上肢的鱗屑白色且細(xì)小,而膝蓋和腿部的鱗屑較厚且較大。手腳背部和褶皺處也有白色鱗屑。還觀察到輕微的掌跖角化病和短指畸形。沒(méi)有外翻,耳朵正常。有趣的是,眼科檢查發(fā)現(xiàn)雙側(cè)近視和小球形晶狀體。
魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的基因檢測(cè)結(jié)果示例
利用多基因組,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼在五種不同基因( NIPAL4、TGM1、CYP4F22、ABCA12和CERS3 )中鑒定了八種致病變異(表?1)。
NIPAL4基因突變分析顯示,A 家族和 C1 患者中存在兩種不同的純合狀態(tài)的生殖系錯(cuò)義突變。先進(jìn)個(gè)是外顯子 1 中的新突變(c.188T > C;ENST00000311946.7),它將蛋氨酸替換為蘇氨酸(p.Met63Thr;ENSP00000311687.7)。據(jù)收錄,A 家族受影響成員(A3、A4 和 A7)有兩種 ARCI 表型(CIE 和 LI)。為了確認(rèn)該突變的分離及其與 ARCI 的關(guān)聯(lián),對(duì)所有可用的家族成員和對(duì)照人群進(jìn)行了桑格測(cè)序。該突變對(duì)于父母而言處于雜合狀態(tài),而在未受影響的成員和對(duì)照個(gè)體中不存在(圖。 2A)。
圖 2:A 和 F 家族中NIPAL4和ABCA12基因的新錯(cuò)義突變的序列色譜圖和序列比對(duì)示例。a NIPAL4的序列色譜圖: A 家族中父母和患病子女分別處于雜合和純合狀態(tài)時(shí)的 c.188 T > C;虛線形狀表示 LI 表型,陰影形狀表示 CIE,黑色形狀表示 ILC 類型b還給出了不同物種中 NIPA4 蛋白的序列比對(duì),顯示整個(gè)物種中蛋氨酸殘基的保守性;c ABCA12的序列色譜圖:F 家族中父親和患病子女分別處于純合和雜合狀態(tài)時(shí)的 c.5898G > C d用多態(tài)性進(jìn)行的 ABCA12 蛋白序列比對(duì),顯示整個(gè)物種中 Glu 殘基的保守性。
第二種致病變異(c.534A > C;ENST00000311946.7)發(fā)生在NIPAL4基因的外顯子 4 中,將谷氨酸氨基酸替換為天冬氨酸(p.Glu178Asp;ENSP00000311687.7)。該變異是在一名 CIE 患者(C1,34 歲)中發(fā)現(xiàn)的,該患者出現(xiàn)輕度皮膚紅斑,褶皺處有小片白色鱗屑。
在純合狀態(tài)下檢測(cè)到兩個(gè)新的錯(cuò)義突變:患有 ILC 的 F 家族(F1 和 F2 患者)中ABCA12基因中的 c.5898G > C(ENST00000389661.4)(p.Glu1966Asp;ENSP00000374312.4)和 c.2855A > G(ENST00000389661.4)(p.Tyr952Cys;ENSP00000374312.4)(圖。 2c). 分離分析證實(shí)患者父親存在這些變異,且處于雜合狀態(tài)。賊初懷疑有Netherton綜合征和多變性紅斑角化病表型,但未發(fā)現(xiàn)毛干異常,也未發(fā)現(xiàn)SPINK5和EKV基因(GJB2、GJB3、GJB4、GJB6和KDSR)突變(數(shù)據(jù)未顯示)。
在三例無(wú)綜合征性魚鱗病患者(M1、B1 和 Y1)中,涉及的基因?yàn)門GM1,具有兩個(gè)不同的純合無(wú)義種系突變(表?1)。有趣的是,這兩種變異在 gnomAD 數(shù)據(jù)庫(kù)中僅以雜合狀態(tài)描述。該基因中賊常見(jiàn)的突變是外顯子 5 中的 c.788G > A (ENST00000206765.6) (p.Trp263X; ENSP00000206765.6),分別在患有 CIE 和 LI 的 M1 和 B1 中檢測(cè)到。TGM1 基因中的第二個(gè)反復(fù)性致病變異是位于外顯子 7 (p.Arg348X; ENSP00000206765.6) 的 c.1042C > T (ENST00000206765.6),在 19 歲的患者 Y1 中檢測(cè)到,該患者表現(xiàn)出 LI 表型。
患有 LI 的 K1 患者在外顯子 8 中有一個(gè)純合錯(cuò)義突變 (c.844C > T; ENST00000269703.3),導(dǎo)致CYP4F22基因中的精氨酸被色氨酸取代 (p.Arg282Trp; ENSP00000269703.1) 。在 gnomAD 數(shù)據(jù)庫(kù)中,這種變異也僅在雜合狀態(tài)下報(bào)告。
魚鱗病致病基因鑒定基因解碼還發(fā)現(xiàn),在一名患有綜合征性魚鱗?。ò橛醒鄄咳毕莸?CIE)的 15 歲患者 (E1) 中,CERS3基因外顯子 13 存在純合缺失。
基因解碼分析中的生物信息學(xué)預(yù)測(cè)
如表所述?表1,2,并且根據(jù)魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的計(jì)算機(jī)模擬研究,所有新的錯(cuò)義變異均被歸類為有害變異。因此,對(duì)于以下突變,使用 Polyphen2、SIFT、Mutation Taster、Panther 和 CADD 組合,沒(méi)有一個(gè)變異被預(yù)期為良性多態(tài)性:NIPAL4基因中的 p.Met63Thr 和ABCA12基因中的 p.Glu1966Asp、p.Tyr952Cys 。魚鱗病致病基因鑒定基因解碼必須提到,所有新變異之前均未在 gnomAD 數(shù)據(jù)庫(kù)中報(bào)告過(guò)。
此外,相應(yīng)蛋白質(zhì)的多重比對(duì)表明這些殘基位于高度保守的區(qū)域內(nèi)(圖 2b、d)。
魚鱗病基因檢測(cè)結(jié)果的先進(jìn)性和臨床幫助
魚鱗病致病基因鑒定基因解碼收集了 11 名患有不同形式魚鱗病的突尼斯患者的詳細(xì)表型數(shù)據(jù)。為了識(shí)別致病基因突變,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼使用了定制的多基因面板。該面板賊重要的方面之一是它能夠根據(jù)新發(fā)現(xiàn)輕松升級(jí)。此外,與全外顯子組測(cè)序相比,多基因面板的分析更容易、更快捷??傮w而言,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼在 5 種不同基因(NIPAL4、TGM1、CYP4F22、ABCA12和CERS3 )中發(fā)現(xiàn)了 8 種致病變異。其中三種是新的( NIPAL4中的 c.118C > T ; ABCA12中的 c.5898G > C 和 c.2855A > G )。使用生物信息學(xué)工具,這些變異被預(yù)測(cè)為致病的,并導(dǎo)致結(jié)構(gòu)蛋白修飾,表明它們與魚鱗病有關(guān)。此外,根據(jù) ClinVar 數(shù)據(jù)庫(kù),已描述的突變都是致病的,但CYP4F22基因中的 c.844 C > T 除外,該突變被歸類為不確定的顯著變異。然而,這種變異與 LI 和 CIE 表型均相關(guān)。此外,與 c.844 C > T 變異接近的 c.845G > A (p.Arg282Gln) 變異在 ClinVar 中被歸類為可能致病,表明該突變具有致病作用。
與文獻(xiàn)中的 ARCI 系列不同,其中TGM1是先進(jìn)個(gè)致病基因,而在魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的隊(duì)列中,NIPAL4是涉及賊多的基因 (36%),有兩個(gè)錯(cuò)義突變 (c.534A > C 和 c.118T > C)。這種不一致可能是由于魚鱗病致病基因鑒定基因解碼研究中調(diào)查的患者數(shù)量較少所致。
表型-基因型相關(guān)性是本研究的主要目標(biāo)之一。除了發(fā)現(xiàn)導(dǎo)致魚鱗病的基因的新變異外,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼還試圖突出與特定基因型相關(guān)的新臨床特征。在這種情況下,在攜帶兩個(gè)新的 ABCA12 基因錯(cuò)義突變的患者中發(fā)現(xiàn)了一種特殊形式的非綜合征性魚鱗病 (ILC),具有多個(gè)局部多環(huán)紅斑和鱗狀斑塊以及褐色細(xì)鱗片。這些變異和臨床相關(guān)方面以前從未收錄過(guò)。事實(shí)上,該基因與 HI 表型(純合或復(fù)合雜合截短突變)或 CIE/LI(錯(cuò)義突變)有關(guān) 。另一方面,ILC 與Netherton綜合征截然不同,后者將 ILC 與特定的毛干異常聯(lián)系起來(lái),而是由SPINK5基因突變引起的。清晰地觀察到,在ILC 患者中未發(fā)現(xiàn)SPINK5基因的致病變異,也沒(méi)有發(fā)現(xiàn)與變異性紅斑角化病 (EKV) 有關(guān)的基因的致病變異(數(shù)據(jù)未顯示),從而證實(shí)了不同的病因。賊近,Leersum 等人 還收錄了一種新的魚鱗病臨床表型,發(fā)生在一名 3 歲女孩身上,該女孩表現(xiàn)出由ABCA12嵌合體引起的沿著 Blaschko 線的線性紅斑鱗屑性病變。這種特殊形式的魚鱗病可以通過(guò)該基因的種系突變和獲得性合子后突變的結(jié)合來(lái)解釋。據(jù)收錄, ABCA12基因也存在于具有錯(cuò)義突變的毛發(fā)角化病和粉刺性痣中,皮脂腺中的蛋白質(zhì)表達(dá)水平很高,而ABCA12編碼區(qū)沒(méi)有任何變異。
此外,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的調(diào)查顯示,75% 的NIPAL4突變患者表現(xiàn)出非綜合征性 CIE 表型。對(duì)于TGM1突變患者,66.67% 的患者表現(xiàn)出 LI 表型。這些觀察結(jié)果證實(shí)了其他研究,表明NIPAL4突變通常與中度表型相關(guān),有細(xì)小的灰白色鱗片,而TGM1突變與更嚴(yán)重的表型相關(guān),有較暗、粘附和板狀鱗片。
魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的研究結(jié)果表明,一些臨床特征與特定基因型相關(guān)(表2)。因此,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼注意到所有TGM1基因突變的病例都患有短指癥。兩名攜帶TGM1突變的突尼斯 LI 患者也報(bào)告了這種具有“長(zhǎng)手掌/短手指”表現(xiàn)的表型。盡管文獻(xiàn)中沒(méi)有收錄,但魚鱗病致病基因鑒定基因解碼建議將短指癥視為TGM1突變的征兆。據(jù)魚鱗病致病基因鑒定基因解碼所知,在 E1 患者中也觀察到的這種表型之前從未在攜帶CERS3突變的 ARCI 患者中收錄過(guò)。魚鱗病致病基因鑒定基因解碼認(rèn)為這種癥狀可能是由ADAMTS17基因缺失引起的[ 43 ]。事實(shí)上,據(jù)收錄,三個(gè)突尼斯近親家族患有與眼部、心臟和骨骼異常相關(guān)的魚鱗病,并且存在創(chuàng)始純合連續(xù)基因缺失(包括CERS3的外顯子 13、非編碼 RNA FLJ42289 的完整序列和ADAMTS17的前三個(gè)外顯子)[ 44 ]。由于 E1 患者表現(xiàn)出與眼部異常相似的皮膚表型,并且來(lái)自同一地區(qū),因此她很可能攜帶相同的缺失。為了證實(shí)這一假設(shè),有必要進(jìn)行進(jìn)一步的分析。
表2:魚鱗病的臨床表征及其背后的基因序列變化基因
基因 | 臨床特征 | 表型 |
---|---|---|
NIPAL4 | 火棉膠嬰兒,眼瞼外翻,皺褶受累,掌跖角化過(guò)度 | CIE, LI |
TGM1 | 短指癥、火棉膠嬰兒、眼瞼外翻、皺褶受累、掌跖角化過(guò)度、耳朵畸形、脫發(fā) | CIE, LI |
CYP4F22 | 火棉膠嬰兒,掌跖角化過(guò)度癥 | LI |
CERS3 ( ADAM17 ) | 短指癥、皺褶受累、掌跖角化過(guò)度 | CIE, LI• |
CIE先天性魚鱗病樣紅皮??;LI板層狀魚鱗病;CIE •伴有眼部缺陷的 CIE
在魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的隊(duì)列中,有 7 名患者出生時(shí)為火棉膠嬰兒,并且TGM1(3/7)、NIPAL4(3/7)或CYP4F22(1/7)基因發(fā)生突變。文獻(xiàn)中,該臨床特征與TGM1和NIPAL4突變顯著相關(guān),頻率各不相同(28–73%)。但也有收錄稱,攜帶ABCA12、CERS3、ALOX12B、ALOXE3、CYP4F22、脂肪酶 N、PNPLA1和SDR9C7基因突變的患者也會(huì)出現(xiàn)這種情況。
所有研究的TGM1突變患者均出現(xiàn)眼瞼外翻,50% 的NIPAL4突變患者也出現(xiàn)眼瞼外翻。這一發(fā)現(xiàn)與文獻(xiàn)數(shù)據(jù)一致,并證實(shí)了之前的觀察結(jié)果,即攜帶TGM1突變的 ARCI 患者更有可能出現(xiàn)雙側(cè)眼瞼外翻。
在魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的研究中,2 名NIPAL4變異患者和CYP4F22變異患者的皮膚褶皺均未受累。盡管基因解碼收錄了皮膚褶皺是受累的好發(fā)部位,但即使未受累,較大的皮膚褶皺也不能排除NIPAL4和CYP4F22基因變異的可能性。
魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的研究結(jié)果表明,掌跖角化病與NIPAL4、TGM1、CYP4F22突變和CERS3缺失有關(guān),但嚴(yán)重程度各不相同。因此,在 p.Met63Thr NIPAL4變異患者中,PPK 為中度或缺失。然而,文獻(xiàn)收錄,在 p.Glu178 Asp NIPAL4突變患者中,PPK 相當(dāng)黃且嚴(yán)重。事實(shí)上,在NIPAL4系列中已報(bào)告黃色 PPK,據(jù)魚鱗病致病基因鑒定基因解碼所知,它從未與其他 ARCI 基因相關(guān)。因此,黃色角化病可能提示ARCI 患者的NIPAL4突變。此外,患者 C1 的右手小指周圍出現(xiàn)一條縮窄帶,提示患有假性白內(nèi)障(圖1b) 后者是 ARCI 和幾種其他角化疾病(如 Vohwinkel 綜合征和 Mal de Meleda)的罕見(jiàn)并發(fā)癥。有人認(rèn)為假性白斑可能是反復(fù)感染或厚角蛋白板壓迫的結(jié)果。然而,ARCI 的確切致病機(jī)制仍不清楚。
在魚鱗病致病基因鑒定基因解碼的TGM1突變患者中,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼主要報(bào)告手掌和腳底的超線性,有時(shí)伴有嚴(yán)重的 PPK。
兩名攜帶 TGM1 突變的患者(B1 和 Y1)報(bào)告出現(xiàn)耳畸形,一名攜帶TGM1突變的患者(M1)報(bào)告出現(xiàn)脫發(fā)。與其他 ARCI 形式相比,TGM1、ABCA12、ALOX12B和ALOXE3突變更常出現(xiàn)耳畸形。研究發(fā)現(xiàn)脫發(fā)與TGM1突變顯著相關(guān)。
然而,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼還發(fā)現(xiàn),不同的表型是由同一基因的相同突變引起的。值得注意的是,在 CIE(M1 患者)和 LI(B1 患者)中都發(fā)現(xiàn)了TGM1基因中的 c.788G > A,這表明修飾基因的作用已經(jīng)得到收錄。為了解釋這種表型異質(zhì)性,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼檢查了編碼絲聚蛋白的FLG基因。魚鱗病致病基因鑒定基因解碼在 M1 中發(fā)現(xiàn)了 44 個(gè)錯(cuò)義多態(tài)性,而 B1 中不存在(數(shù)據(jù)未顯示)。這些多態(tài)性的預(yù)測(cè)效果表明大多數(shù)是良性的。
總而言之,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼報(bào)告了三種新的突變,其中兩種位于導(dǎo)致 ILC(一種罕見(jiàn)的魚鱗病臨床形式)的ABCA12基因中,以及與特定基因型相關(guān)的新臨床特征。
關(guān)于魚鱗病基因檢測(cè)的共識(shí)性意見(jiàn)
表型-基因型相關(guān)性表明,短指癥可能與TGM1突變有關(guān),并與ADAMTS17基因缺失有關(guān),后者與CERS3外顯子 13的缺失有關(guān)。
除了新收錄的NIPAL4和ABCA12基因變異外,魚鱗病致病基因鑒定基因解碼還對(duì)已收錄的與特定基因相關(guān)的特定表型增加了新的見(jiàn)解。此類基因在特定 ARCI 形式中的參與程度仍有待討論。為了更好地解釋其表型異質(zhì)性,有必要對(duì)整個(gè)基因組進(jìn)行研究以尋找負(fù)責(zé)的修飾基因。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)