【佳學基因檢測】色素失禁基因檢測——助力準確診斷
眼科基因檢測導讀:
色素失禁(或稱色素沉著障礙)是一類影響皮膚色素分布和產(chǎn)生的疾病。基因檢測在這方面可以提供很大的幫助,因為很多色素失禁的疾病是由特定的基因突變引起的。
佳學基因檢測的色素失禁基因檢測服務旨在幫助準確診斷這種疾病。以下是一些可能的檢測內(nèi)容和其幫助:
-
基因突變識別:檢測可能涉及識別與色素失禁相關的基因突變。例如,常見的與色素失禁相關的基因包括MC1R、SLC45A2等。通過分析這些基因的變異,檢測可以幫助確認是否存在特定的遺傳標記。
-
準確診斷:基因檢測可以幫助醫(yī)生更準確地診斷病情,避免傳統(tǒng)方法中可能存在的誤診或漏診現(xiàn)象。對于一些癥狀不明顯或者表現(xiàn)多樣的色素失禁疾病,基因檢測尤為重要。
-
個性化治療:通過了解具體的基因突變情況,醫(yī)生可以制定個性化的治療方案或管理策略,可能包括藥物治療、激光治療等。
-
遺傳咨詢:基因檢測還可以提供遺傳咨詢服務,幫助家庭了解遺傳風險,并對未來的孩子進行適當?shù)念A防或治療措施。
總體而言,佳學基因檢測的色素失禁基因檢測通過提供詳細的基因信息,有助于更準確地診斷和管理色素失禁疾病。如果你或你的家人有色素失禁相關的癥狀,考慮進行基因檢測可能是一個有效的選擇。
目前診斷色素失禁的技術
色素失調(diào)癥(IP)的分子診斷分析方法應考慮指示病例的性別。這是因為在 色素失調(diào)癥(IP)女性中,該變異處于組成性雜合狀態(tài)。這表明它存在于體內(nèi)所有細胞中。然而,如果合子后突變發(fā)生在男性群體中,胚胎嵌合體可使兩組遺傳上不同的群體共存于同一個體中。此外,表達IKBKG/ NEMO 變異的細胞可能逐漸被消除并最終被清除,這使得男性患者的診斷極其困難。簡單的 PCR 檢測外顯子 4-10 的基因缺失仍然是IKBKG變異篩查的推薦技術,因為復發(fā)性缺失占女性 色素失調(diào)癥(IP)病例的 79% 或全部色素失調(diào)癥(IP)病例的 70% 。如果未檢測到外顯子 4-10 缺失,則可使用 Sanger 測序篩查IKBKG編碼區(qū)和內(nèi)含子-外顯子連接處的點突變和插入缺失,將提高 9% 的診斷靈敏度。除此之外,qPCR 還可用于檢測除經(jīng)典的外顯子 4-10 缺失以外的更大的序列變化,這占 色素失調(diào)癥(IP)病例的約 4%。盡管下一代測序更加廣泛且更便宜,但由于假基因IKBKGP1的存在,它被認為無法用于色素失調(diào)癥(IP)診斷。IKBKG和IKBKGP1都位于 Xq28 區(qū)域內(nèi),并且有 99% 的序列相同。該假基因的存在使傳統(tǒng)的捕獲探針數(shù)據(jù)分析變得困難,因為它減少了讀取深度,降低了突變位點定位精度,并導致比對讀取不佳,從而導致假陽性結(jié)果。然而,下一代測序 (NGS)/全外顯子組測序 (WES) 流程分析中掩蓋IKBKGP的生物信息學調(diào)整利用了該技術,成為檢測IKBKG突變的有力工具。憑借此類創(chuàng)新,NGS/WES 無疑加速了IKBKG突變篩查,可替代或補充傳統(tǒng)的 Sanger 法。如果使用與女性患者相關的方法,男性患者中發(fā)生的低水平嵌合體可能會逃避分子診斷。不應從外周血中提取基因組 DNA,而應使用從疑似表型中選擇的組織(即皮膚)進行測試,并分析多種組織,即血液、新鮮皮膚、唾液和精子樣本,以檢測低水平嵌合體。因此,后者成本更高,并且需要更具體的能力和基礎設施。對于基因解碼價格敏感的受檢者可能以失去敏感性而補償。
色素失調(diào)癥的致病基因鑒定基因解碼
不同人群中色素失調(diào)癥的遺傳變異
色素失調(diào)癥(IP)中最常見的基因突變是IKBKG基因中約 11.7 kb 的缺失,該缺失刪除了外顯子4 至 10。這種突變是 70%–80% 的 色素失調(diào)癥(IP)患者的發(fā)病原因(22-24)。這在歐洲、中國、日本、韓國和印度人群中都有發(fā)現(xiàn)。除了11.7 kb的缺失之外,IP還可能由于 IKBKG 基因上的其他類型的突變而產(chǎn)生,包括單核苷酸替換、點突變和小插入/缺失 (indel)。點突變可以是導致蛋白質(zhì)翻譯過早終止的無義突變,也可以是導致氨基酸改變的錯義突變。小的 indel 可能導致移碼或框內(nèi)氨基酸缺失。點突變和插入/缺失均可能導致IKBKG mRNA 的異常剪接。這些突變可導致IKBKG蛋白缺失或缺陷,從而產(chǎn)生 色素失調(diào)癥(IP)的臨床癥狀?;蚪獯a通過分析不同的突變特征,而可以檢測出更多的致病性突變,從而提高檢出率,降低假陰性結(jié)果。除涉及外顯子的突變外,基因檢測數(shù)據(jù)庫中還收錄了中國人群中的涉及內(nèi)含子 8 的單核苷酸多態(tài)性。盡管收錄的病例較少,但這種多態(tài)性也在高加索人群中有所報道。雖然大多數(shù)關于 色素失調(diào)癥(IP)病例的報道來自西方人群和某些東亞地區(qū),但在非洲、印度、馬來西亞和巴西等其他人群中也觀察到了 色素失調(diào)癥(IP)病例。
IKBKG色素失禁的病理生理學
IκB 激酶 (IKK) 蛋白復合物由催化亞基 IKKα 和 IKKβ 以及 IKKγ (NEMO) 組成。IKBKG基因負責編碼 IKKγ (NEMO),而 IKKγ (NEMO) 是抑制劑 κB (IκB) 激酶 (IKK) 復合物的調(diào)節(jié)亞基,而該復合物對于許多基本生理功能所需的 NF-κB 通路激活至關重要。IKK 復合物激活后,IκB 蛋白磷酸化、泛素化和降解會導致激活 NF-κB 復合物的抑制劑被去除。IκB 的缺失使得 NF-κB 能夠轉(zhuǎn)位到細胞核中,在那里可以進行目標基因的轉(zhuǎn)錄。據(jù)報道,活化的 NF-κB 可執(zhí)行免疫和炎癥反應,并參與防止信號蛋白誘導的細胞凋亡。因此, IKBKG基因的功能喪失或缺失會導致IKK功能障礙,從而導致 NF-κB 活性終止。如果沒有NF - κB ,色素失調(diào)癥(IP)細胞對促凋亡信號高度敏感。
在男性嵌合體和女性X染色體異常的情況下,鄰近的未發(fā)生IKBKG基因突變、表達IKKγ(NEMO)蛋白的角質(zhì)形成細胞,在接收到正在凋亡或壞死的IKBKG缺陷型角質(zhì)形成細胞的激活信號后,可發(fā)生NF-κB激活。凋亡或壞死細胞產(chǎn)生的激活信號包括危險相關分子模式(DAMP)以及“找到我”信號,如溶血磷脂酰膽堿(LCP)、鞘氨醇1-磷酸(S1P)、核苷酸ATP/AUP和腫瘤生長因子(TGFβ)等。附近表達IKBKG 的角質(zhì)形成細胞中 NF-κB 的激活將導致趨化因子的產(chǎn)生,例如調(diào)節(jié)活化、正常 T 細胞表達和分泌 (RANTES)、單核細胞趨化蛋白 (MCP-1) 和嗜酸性粒細胞趨化因子,從而募集嗜酸性粒細胞。此外,還會產(chǎn)生促炎細胞因子,例如 IL-1、TNF-α、IFN-γ、淋巴細胞趨化因子?;蚪獯a發(fā)現(xiàn),IL-1 和 TNF-α 可以上調(diào)嗜酸性粒細胞趨化因子的產(chǎn)生,從而吸引嗜酸性粒細胞遷移。募集的嗜酸性粒細胞將發(fā)生脫顆粒并釋放蛋白酶,導致表皮和身體其他部位發(fā)炎 (圖1)。
圖1:色素失調(diào)癥中的IKBKG /NF-κB 病理生理學
IKBKG基因是激活核因子 κB (NF-κB) 信號通路所必需的。在無刺激條件下,NF-κB 通過與 NEMO/IKKgamma(由IKBKG編碼)結(jié)合在細胞質(zhì)中保持非活性。IKK 復合物對抑制性 NF-κB (IκB) 蛋白的磷酸化導致其蛋白酶體降解并隨后釋放 NF-κB 二聚體(由 p50 和 relA 亞基組成)。大多數(shù)患有色素失調(diào)癥的個體攜帶IKBKG基因的常見致病變異,外顯子 4-10 缺失,導致 NF-κB 信號通路失活。缺乏IKBKG 的角質(zhì)形成細胞由于失去對細胞死亡的保護而易發(fā)生凋亡/壞死。 DAMPS 和“找到我”信號(ATP/UTP、S1P、LPC、TGFβ)被釋放,并作為刺激免疫炎癥反應的激活信號。單核細胞、巨噬細胞、T 細胞和 NK 細胞已被證明會釋放細胞因子(IL-1α、IL-1β、TNF-α、IFN-γ、淋巴細胞趨化因子)和趨化因子(RANTES、MIP-1α、MIP-1β、MIP-2、MCP-1、嗜酸性粒細胞趨化因子),從而導致嗜酸性粒細胞的募集。募集的嗜酸性粒細胞脫顆粒,釋放蛋白酶,幫助降解角質(zhì)形成細胞之間的粘連。這會導致海綿狀水腫和水皰形成,這在色素失調(diào)癥(IP)患者的第一階段臨床表現(xiàn)中經(jīng)常觀察到。除了主要表現(xiàn)為皮膚病外,色素失調(diào)癥(IP)患者還經(jīng)常報告出現(xiàn)中樞神經(jīng)系統(tǒng)和眼部異常。 NF-κB缺陷的內(nèi)皮細胞和全身其他細胞趨化因子過度表達,導致嗜酸性粒細胞增多,引發(fā)廣泛炎癥,內(nèi)皮炎癥導致血管阻塞和缺血,導致視網(wǎng)膜和神經(jīng)系統(tǒng)的表現(xiàn)。
在表皮中,蛋白酶降解張力絲和橋粒,導致細胞內(nèi)水腫(海綿狀水腫)并最終起水泡,這在 色素失調(diào)癥(IP)的第一階段可見。隨著IKBKG缺陷角質(zhì)形成細胞的減少(由于細胞凋亡增加、逐漸被表達IKBKG的角質(zhì)形成細胞所取代以及炎癥消退),皮膚病變逐漸消失。此外,TNF 和其他細胞因子可能在炎癥早期在表皮中產(chǎn)生,并可能在直接消除IKBKG缺陷角質(zhì)形成細胞的過程中發(fā)揮作用。然而,成功逃脫并在消除過程中存活下來的殘留IKBKG缺陷角質(zhì)形成細胞可能會因角質(zhì)形成細胞過度增殖和隨后的炎癥反應而經(jīng)歷 色素失調(diào)癥(IP)第一階段的第二次發(fā)作。
如果 NF-κB 缺陷的內(nèi)皮細胞和全身其他細胞過度表達嗜酸性粒細胞特有的趨化因子(如嗜酸性粒細胞趨化因子),則可能導致全身性嗜酸性粒細胞增多癥。嗜酸性粒細胞與其他炎癥因子相結(jié)合會導致廣泛炎癥。內(nèi)皮炎癥會導致血管阻塞和缺血,導致視網(wǎng)膜和神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)。視網(wǎng)膜動脈阻塞導致區(qū)域無血管和灌注不足,從而引發(fā)缺血。新生血管形成是其后遺癥。在中樞神經(jīng)系統(tǒng),腦萎縮和其他神經(jīng)系統(tǒng)后遺癥被認為在視網(wǎng)膜缺血事件中具有相似的血管閉塞性缺血病理生理學。
NF-κB在保護腦內(nèi)皮細胞和血腦屏障的完整性方面發(fā)揮著作用。NF-κB缺陷使內(nèi)皮細胞易受各種潛在刺激,包括感染。這些刺激上調(diào)促炎細胞因子,如IL-6、-8和-10,導致內(nèi)皮炎癥和隨后的動脈病變。這解釋了全身抗炎在治療IP患者神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)中的作用。然而,中樞神經(jīng)系統(tǒng)病變的具體發(fā)病機制仍存在爭議。
色素失禁的基因型-表型相關性
關于基因型-表型相關性的研究很少。一項對 10 名日本患者及其 3 名母親的研究表明,有或沒有IKBKG基因重排的患者在皮膚外表現(xiàn)方面沒有明顯差異。佳學基因解碼對 42 名 色素失調(diào)癥(IP)患者進行的研究發(fā)現(xiàn),具有陽性IKBKG致病變異的患者與未具有該致病變異的患者相比似乎具有不同的臨床變異。研究觀察到,具有陽性IKBKG突變的患者毛發(fā)(50 vs. 14%)、牙齒(70 vs. 21%)、眼部異常(45 vs. 29%)的頻率較高,中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常的頻率較低(20 vs. 35%)。這一差異表明需要深入評估這些組之間的關鍵表型和基因分型差異。既往研究發(fā)現(xiàn),色素失調(diào)癥(IP)的臨床表型變化很大,從輕度皮膚改變(輕度 IP)到中風和功能性中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常(重度 IP)。致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn)重度中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常有隨機的 X 失活,而無或輕度中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常則有偏斜的失活。另一方面,發(fā)現(xiàn)突變類型(常見缺失與點突變)與疾病嚴重程度無關。這可能是真的,因為 NEMO/IKKgamma 蛋白在調(diào)節(jié)各種基因表達的復雜信號通路中發(fā)揮作用,它的突變會產(chǎn)生不同的表型結(jié)果,這可能解釋了 色素失調(diào)癥(IP)中觀察到的整個異常譜。
色素失禁癥致病基因鑒定基因解碼使用的表型評分系統(tǒng)研究色素失調(diào)癥(IP)患者突變類型與臨床表現(xiàn)之間的相關性,結(jié)果表明外顯子 4-10 IKBKG缺失患者的表型評分變化很大,而次等位基因突變可能具有更廣泛的表型后果,因為在 X 染色體失活過程后不久,該突變?nèi)圆糠只钴S。因此,保留一些活性的突變表現(xiàn)出非典型表型,其特征是與經(jīng)典色素失調(diào)癥(IP)表型相比,涉及的組織更多。這在具有更嚴重中樞神經(jīng)系統(tǒng)和眼部缺陷的 色素失調(diào)癥(IP)患者中可見,因為不平衡的 X 染色體失活可能會調(diào)節(jié)疾病的嚴重程度 ( 25 )。此外,在不同基因組背景下攜帶相同IKBKG突變的患者的疾病表達差異可以通過其他遺傳因素(例如在許多孟德爾疾病中觀察到的修飾基因)來解釋。迄今為止,色素失調(diào)癥(IP)中沒有顯著的基因型-表型關系。然而,研究表明,突變類型、受影響的功能域、X 失活和基因組背景的組合可能導致 色素失調(diào)癥(IP)表型的變異性。比較詳見表格1。
表1:常見外顯子 4-10 缺失與其他缺失之間的皮膚外差異
(n)、人口、性別 | 結(jié)果(陽性結(jié)果/總數(shù),%) | 皮膚外表型,n (%) | 結(jié)論 | |
基因檢測陽性(delExon 4-10) | 基因檢測陰性(外顯子 4-10) | |||
n = 10 日語,女 | 5 / 10, 50% | 脫發(fā),3/5 (60) | 脫發(fā)——無 | 他們的研究和其他人的研究中,皮膚外表現(xiàn)沒有明顯差異 |
眼部表現(xiàn) 3/5 (60) | 眼部表現(xiàn) 1/5 | |||
神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn) 1/5 (20) | 神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn) 1/5 | |||
CVS 表現(xiàn) - 無 | CVS 表現(xiàn)——無 | |||
描述牙齒和指甲異常 | ||||
n = 42,男女 | 20/34, 58.8% | 頭發(fā)−10/20 (50) | 頭發(fā)−2/14 (14) | IKBKG致病變異陽性與陰性IP隊列存在臨床差異 |
白人,27/42 (64%) | 指甲−2/20 (10) | 指甲−2/14 (14) | ||
西班牙裔,1/42 (2%) | 牙齒−14/20 (70) | 牙齒−3/14 (21) | ||
亞裔,9/42 (21%) | 腭−0/20 (0) | 腭−1/14 (7) | ||
黑人,4/42 (10%) | 眼睛−9/20 (45) | 眼睛−4/14 (29) | ||
中樞神經(jīng)系統(tǒng)−4/20 (20) | 中樞神經(jīng)系統(tǒng)−5/14 (36) | |||
n = 25,韓國人,女性 | 20/25, 80% (通用外顯子 4-10) | 頭發(fā)−5/20 | 頭發(fā)−0/5 | 皮膚外表現(xiàn)或表型評分的發(fā)生率無統(tǒng)計學顯著差異 |
5/25, 20% (基因內(nèi)序列變異) | 指甲−2/20 牙齒−3/20 | 指甲−0/5 牙齒−0/5 | ||
眼睛 | 眼睛−3/5 | |||
−4/20 | 中樞神經(jīng) | |||
中樞神經(jīng)系統(tǒng)−5/20 | 系統(tǒng)−2/5 |
M,男性;F,女性;CNS,中樞神經(jīng)系統(tǒng)。
色素失禁癥基因檢測如何指導治療
目前的治療策略需要多學科專家(包括但不限于皮膚科、神經(jīng)科、兒科、遺傳學家和眼科醫(yī)生)的參與。治療方法包括癥狀控制、康復和預防并發(fā)癥。
對于皮膚出現(xiàn)嚴重炎癥的疣狀病變的患者,可使用局部或全身性類固醇和/或局部鈣調(diào)磷酸酶抑制劑治療。據(jù)報道,類視黃酸可使疼痛的疣狀腫瘤消退。醫(yī)生不應試圖用激光治療色素沉著,因為這可能會加劇皮膚炎癥。應強調(diào)光保護,因為紫外線照射會加重皮膚病變。
一旦確診為 IP,應立即進行眼科檢查,因為這可能具有視力保護作用。應使用用于篩查早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變的方案。如果有外周血管病變的證據(jù),則需要在全身麻醉下進行眼底照相和熒光血管造影檢查。氬激光可用于治療無灌注區(qū),可能需要重復激光光凝。雷珠單抗已被描述用于治療難治性增生性視網(wǎng)膜病變 ,作為激光光凝失敗的輔助治療。斜視和視網(wǎng)膜脫離可以通過手術修復。普萘洛爾被認為是治療早產(chǎn)兒視網(wǎng)膜病變的潛在方法。
新生兒早期神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)決定了患者的長期預后和殘疾的發(fā)生。大多數(shù)沒有新生兒中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常的患兒通常具有正常的身體和認知發(fā)育。因此,在準確的皮膚病學檢查后進行詳細的早期神經(jīng)系統(tǒng)檢查至關重要。應使用腦電圖 (EEG) 和腦部 MRI 檢查癲癇發(fā)作。新生兒期的兩個主要治療目標包括抗癲癇治療和消炎藥物???a href='http://vigrxplusreviewsreal.com/cp/chabiyin/shenjin/2023/40917.html' target='_blank'>癲癇藥物的選擇取決于癲癇發(fā)作的癥狀和患者的年齡,而類固醇是首選的消炎藥物。最近,抗 TNF 已被成功使用。基因療法因其在糾正嚴重腦血管病變方面的潛力而受到研究 ?;加猩窠?jīng)系統(tǒng)后遺癥的患者應盡早接受包括醫(yī)生、物理治療師、語言治療師和職業(yè)治療師在內(nèi)的康復團隊的管理,以減輕神經(jīng)認知和骨科并發(fā)癥。對于那些沒有神經(jīng)系統(tǒng)表現(xiàn)的患者,仍應進行常規(guī)隨訪,以發(fā)現(xiàn)新的神經(jīng)系統(tǒng)、神經(jīng)認知和/或癲癇學表現(xiàn)。
18 歲以下的兒童應定期進行牙科隨訪,以了解牙齒表現(xiàn)并保持牙齒功能??赡艹霈F(xiàn)的問題包括多發(fā)性牙齒發(fā)育不全、冠狀形態(tài)異常、牙頜面矯正異常以及牙齒萌出延遲或缺失。臨時假牙和修復治療可用于替代脫落的牙齒以及牙齒重新定位和排列。當生長停止時,可以開始確定性的種植修復和正畸康復。可能需要進行多學科評估,包括種植牙專家、牙周病專家以及牙頜面矯正和修復專家。
佳學基因檢測下一步工作方向
除了將 PCR 和 Sanger 測序作為 色素失調(diào)癥(IP)基因檢測的金標準方法外,還需要進一步創(chuàng)新和改進具有既定策略的 NGS,以提高 色素失調(diào)癥(IP)分子診斷的靈敏度和特異性。陽性和陰性IKBKG致病變異群之間的臨床差異表明需要深入分析這些群體之間的關鍵基因型和表型差異。對 色素失調(diào)癥(IP)基因型-表型相關性的更大程度的了解將支持臨床醫(yī)生指導受影響的個人及其家人就預后和未來的生殖選擇進行調(diào)查和咨詢。最后,臨床治療包括確定可能的早期免疫抑制劑以減少炎癥標志物,這可能是減少致殘的潛在治療策略,例如視網(wǎng)膜和腦缺血。這可能有助于預防和最佳管理 色素失調(diào)癥(IP)的嚴重并發(fā)癥。
(責任編輯:佳學基因)