【佳學(xué)基因檢測】高通量測序(NGS)基因檢測中擴(kuò)增子的選擇、設(shè)計及優(yōu)化
在新一代基因測序(NGS),如何獲取更多的基因信息是基因解碼的先進(jìn)步。獲取信息多、全、正確,才能做好基因解碼。根據(jù)佳學(xué)基因高通量測序技術(shù)研發(fā)中心介紹。在目前的高通量DNA測序(HTS)應(yīng)用中,擴(kuò)增子測序一直是先進(jìn)方法。但是很多基因測序機(jī)構(gòu)只是非常關(guān)注HTS提供的數(shù)據(jù)量迅速增長的分析方法及常說的生物信息分析方法。對于樣品制備的重要性和生成的測序文庫是否真實(shí)的反映了樣本基因序列的真實(shí)性缺乏關(guān)注。再多的、再復(fù)雜的、再炫酷的高端生物信息學(xué)也無法彌補(bǔ)制備不良的樣本,因此,在制定基因解碼過程中的基因測序標(biāo)準(zhǔn)流程中,佳學(xué)基因提出必須認(rèn)真關(guān)注工作流程中的樣本制備和文庫生成,尤其是涉及多個PCR步驟的樣本制備和文庫生成。佳學(xué)基因付出大量精力,研究和探討擴(kuò)增子工作流程中的實(shí)驗(yàn)操作方面的常常出現(xiàn)的問題,以協(xié)調(diào)樣品采集、測序文庫制備工作中的各個環(huán)節(jié)。通過提供佳學(xué)基因總結(jié)收集的經(jīng)驗(yàn)數(shù)據(jù)來說明問題存在范圍。賊后,從基因測序數(shù)據(jù)生成的實(shí)際情況,分析影響測序結(jié)果的各種參數(shù)。佳學(xué)基因介紹高通量測序的技術(shù)細(xì)節(jié)及分析流程的重要性,以實(shí)現(xiàn)有意義的、經(jīng)得起各種驗(yàn)證的、可適當(dāng)分析的數(shù)據(jù)。由于佳學(xué)基因?qū)U(kuò)增子測序應(yīng)用到從法醫(yī)到環(huán)境DNA(eDNA),從致病基因的鑒定到靶向藥物的尋找,從腫瘤風(fēng)險的預(yù)測到腫腫瘤微小殘留灶的檢測中,具備不斷發(fā)展的應(yīng)用和技術(shù)趨動力。因此,建立有效的工作流程極為重要。
不可否認(rèn),與高通量DNA測序(HTS)相關(guān)的無數(shù)名稱和首字母縮略詞給人留下了深刻的印象,而該技術(shù)本身被證明有用的應(yīng)用數(shù)量也與此相匹配。迄今為止,擴(kuò)增子測序是許多HTS研究中的先進(jìn)方法,通過該方法可以生成PCR產(chǎn)物,轉(zhuǎn)化為文庫,合并然后測序。擴(kuò)增子測序已被廣泛用于或擬用于多種環(huán)境,包括生物監(jiān)測、飲食分析和細(xì)菌宏基因組學(xué)。由于這項技術(shù)可以很容易地應(yīng)用于一系列學(xué)科,它有時會成為尋求利用它的科學(xué)家的雷區(qū)。對于那些在濕實(shí)驗(yàn)室分子生物學(xué)技能或計算生物信息學(xué)方面經(jīng)驗(yàn)有限的人來說尤其如此。這些領(lǐng)域中的后一個受到了廣泛關(guān)注;前者的重要性常常被低估。