【佳學(xué)基因檢測】PrediXcan 在表型與基因型研究中的應(yīng)用

為了讓科研服務(wù)合作伙伴應(yīng)用先進(jìn)的生物信息學(xué)基礎(chǔ)，佳學(xué)基因介紹了通過QTL數(shù)據(jù)集（如GTEx, 在介紹時(shí)，佳學(xué)基因交替使用QTL和GTE，盡管這些分析方法可以在任何轉(zhuǎn)錄組學(xué)研究中使用）對GWAS變異序列進(jìn)行協(xié)調(diào)使用和注釋的方法。

在全基因組關(guān)聯(lián)分析研究中（GWAS)，存大著大量的、各異的數(shù)據(jù)信息，這些研究的特點(diǎn)是使用的平臺不同，注釋的方式不同，調(diào)用的參照基因組也互不相同。

佳學(xué)基因?qū)rediXcan系列分析方法時(shí)行了深入分析，并將其移植到新一代全基因組關(guān)聯(lián)分析研究中，以建立轉(zhuǎn)錄本和人體表征的關(guān)聯(lián)性。當(dāng)變異位點(diǎn)和分析模型數(shù)量有限時(shí)，分析的效果在每一個(gè)轉(zhuǎn)錄組范圍內(nèi)的分析方法中從總體上會降低。

這說明，在一個(gè)特定的GWAS分析中，參與分析基因位點(diǎn)可能與轉(zhuǎn)錄組分析模型不能很好地進(jìn)行匹配，所以預(yù)測效果降低。佳學(xué)基因認(rèn)為，在任何一種應(yīng)用中，都需要考慮GWAS模型中的基因位點(diǎn)的變量交叉分析方式。