【佳學(xué)基因檢測】前列腺癌中的PIK3CA基因檢測:如何應(yīng)用單擊與多擊突變結(jié)果
前列腺癌基因解碼背景
PIK3CA基因編碼了PI3K(磷脂酰肌醇3激酶)的一個亞基,參與細胞增殖、存活和代謝等重要生物過程。PIK3CA突變,尤其是多擊突變,已在多種腫瘤中顯示出對靶向治療的敏感性。在乳腺癌中,攜帶多個PIK3CA短變異(short variant, SV)的腫瘤與改善的治療結(jié)果相關(guān)。這一現(xiàn)象在前列腺癌中的表現(xiàn)和臨床意義通過前列腺癌基因解碼基因檢測得到進一步明確。
前列腺癌基因解碼目的
前列腺癌基因解碼旨在評估臨床晚期前列腺癌(Clinically Advanced Prostate Cancer, CAPC)中單擊和多擊PIK3CA基因突變的基因組特征,為臨床治療提供新見解。
患者和方法
我們利用Foundation Medicine FoundationCore數(shù)據(jù)庫,識別出19,978例接受了混合捕獲基礎(chǔ)的綜合基因組分析的CAPC腫瘤。這些分析評估了所有類型的基因組改變(genomic alterations, GA)以及腫瘤突變負擔(dān)(Tumor Mutational Burden, TMB)、微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(Microsatellite Instability, MSI)、基因組祖先、單堿基替換突變特征以及同源重組缺陷特征(HRD signature)。此外,腫瘤細胞PD-L1表達通過免疫組化(IHC)檢測。
結(jié)果
在分析的19,978例CAPC腫瘤中,有18,741例(93.8%)為PIK3CA野生型(WT),1,155例(5.8%)表現(xiàn)為單擊PIK3CA SV,而82例(0.4%)則為多擊PIK3CA SV。與PIK3CA WT相比,單擊(6.6對3.8,p < 0.0001)和多擊(12.8對3.8,p < 0.0001)腫瘤每個腫瘤的驅(qū)動基因改變數(shù)量顯著增加。此外,單擊和多擊PIK3CA突變的腫瘤表現(xiàn)出更高的MMR突變特征、高MSI狀態(tài)和TMB水平(p < 0.0001)。其他基因組改變方面,多擊組BRCA2的突變頻率(18.3%對8.5%,p = 0.0191)和ATM基因的突變頻率(13.4%對5.6%,p = 0.02)顯著高于WT組,而單擊組PTEN基因的突變頻率(40.2%對30.1%,p < 0.0001)則高于WT組。與單擊組相比,PIK3CA WT的同源重組缺陷特征顯著高(11.2%對7.6%,p = 0.0002)。在PD-L1表達方面,三組之間沒有顯著差異。
討論
前列腺癌基因解碼的結(jié)果表明,前列腺癌中存在著PIK3CA基因的多擊突變,這一特征可能預(yù)示著一種獨特的腫瘤表型。該表型與驅(qū)動基因改變的增加、高TMB以及高MSI狀態(tài)相關(guān),這些因素可能影響腫瘤對抗PIK3CA靶向治療的反應(yīng)。與乳腺癌類似,前列腺癌患者中PIK3CA多擊突變的發(fā)現(xiàn)為其潛在的靶向治療提供了新的方向,尤其是在免疫檢查點抑制劑的應(yīng)用方面。
臨床意義
隨著靶向治療和免疫療法的迅速發(fā)展,了解腫瘤的基因組特征對于制定個體化治療方案至關(guān)重要。我們的前列腺癌基因解碼表明,前列腺癌中的PIK3CA多擊突變可能成為預(yù)后標(biāo)志物,并為相關(guān)臨床試驗的設(shè)計提供基礎(chǔ)。這一發(fā)現(xiàn)強調(diào)了在CAPC患者中進行PIK3CA基因檢測的重要性,特別是在選擇針對PIK3CA的治療時。
結(jié)論
前列腺癌基因解碼揭示了前列腺癌中PIK3CA基因突變的復(fù)雜性,特別是多擊突變可能與腫瘤的治療反應(yīng)相關(guān)。未來的前列腺癌基因解碼應(yīng)進一步探索這些基因組改變?nèi)绾斡绊懪R床結(jié)果,以便為CAPC患者提供更為有效的治療選擇。隨著基因檢測技術(shù)的發(fā)展,我們期待能夠在前列腺癌的管理中看到更好的成果和更多的臨床應(yīng)用。
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)