【佳學(xué)基因檢測(cè)】血友病基因檢測(cè)項(xiàng)目

基因檢測(cè)導(dǎo)讀：

血友病 A 和 B 是由因子 (F) VIII 或 FIX 基因變異引起的。選擇性收錄可能會(huì)影響基因數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的變異分布。血友病致病基因鑒定基因解碼將國(guó)際基于人群的兒科隊(duì)列 (血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)) 中的F8和F9變異譜與歐洲血友病和相關(guān)疾病協(xié)會(huì) (EAHAD) 和疾病控制與預(yù)防中心血友病 A 或血友病 B 突變項(xiàng)目 (CHAMP/CHBMP) 數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)的變異譜進(jìn)行比較。在分析中，1941 名患者的遺傳信息可用。52% 的重度血友病 A 患者存在內(nèi)含子 22 倒位；在倒位陰性的重度血友病 A 患者中，最常見的變異是移碼 (36%)、錯(cuò)義 (28%) 和無義 (20%)。重度血友病 B 中最常見的變異是錯(cuò)義 (48%)。在非重度疾病中，大多數(shù)變異是錯(cuò)義變異（中度血友病 A：91%；輕度血友病 A：95%，中度和輕度血友病 B：各 86%）。與數(shù)據(jù)庫(kù)的比較表明，EAHAD 中與重度血友病 B 相關(guān)的錯(cuò)義變異比例 (68%) 高于血友病基因檢測(cè)(48%) 和 CHBMP (46%)。血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)人群隊(duì)列為通過選擇性收錄收集數(shù)據(jù)的現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)提供了一種替代方案，因?yàn)樗且粋€(gè)維護(hù)良好的數(shù)據(jù)庫(kù)，涵蓋了所有致病F8和F9變異，并指示了受每種特定變異影響的患者數(shù)量。

血友病基因檢測(cè)項(xiàng)目關(guān)鍵詞

因子 VIII、因子 IX、血友病 A、血友病 B、遺傳數(shù)據(jù)庫(kù)、人群

血友病基因檢測(cè)介紹

20 世紀(jì) 80 年代，編碼人類凝血因子（凝血因子 F）VIII 和 FIX 的基因被發(fā)現(xiàn)，這使得血友病致病基因鑒定基因解碼能夠分別識(shí)別出血友病 A 和血友病 B 患者的致病變異。識(shí)別 FVIII/FIX 基因（ F8/F9）中的致病變異對(duì)于確定女性攜帶者和產(chǎn)前診斷非常重要，并且有助于預(yù)測(cè)兒童血友病的嚴(yán)重程度。此外，變異類型已被證明容易導(dǎo)致抑制劑的發(fā)展。

測(cè)序技術(shù)的進(jìn)步提高了變異的識(shí)別率，并促使人們創(chuàng)建數(shù)據(jù)庫(kù)以增加對(duì)血友病遺傳背景的了解。一般或中心突變數(shù)據(jù)庫(kù)，如在線人類孟德爾遺傳 (OMIM) 和人類基因突變數(shù)據(jù)庫(kù) (HGMD) 包含所有基因的變異列表。然而，這些中心數(shù)據(jù)庫(kù)的管理員不一定是所有相關(guān)基因的專家。因此，這些數(shù)據(jù)庫(kù)缺乏對(duì)特定疾病進(jìn)行全面臨床解釋的重要特征。

另一方面，基于基因的數(shù)據(jù)庫(kù)（即基因座特異性數(shù)據(jù)庫(kù) [LSDB]）由對(duì)特定基因或表型具有科學(xué)專業(yè)知識(shí)的致病基因鑒定基因解碼人員運(yùn)行，并且是診斷和致病基因鑒定基因解碼實(shí)驗(yàn)室的重要工具。第一個(gè)F8和F9的 LSDB于 20 世紀(jì) 90 年代初建立 。隨后，基于網(wǎng)絡(luò)的 LSDB 被創(chuàng)建，例如血友病 A 突變、結(jié)構(gòu)和測(cè)試站點(diǎn) (HAMSTeRS) 和 Hemobase。然而，缺乏可用時(shí)間和資金會(huì)對(duì)這些數(shù)據(jù)庫(kù)的維護(hù)產(chǎn)生影響，如果不定期更新，數(shù)據(jù)庫(kù)就會(huì)失去其相關(guān)性。此外，這些數(shù)據(jù)庫(kù)并不總是易于訪問。

因此，美國(guó)疾病控制與預(yù)防中心 (CDC) 以易于訪問的格式編制了一個(gè)變異列表（CDC 血友病 A 突變項(xiàng)目 [CHAMP] 或血友病 B 突變項(xiàng)目 [CHBMP] 數(shù)據(jù)庫(kù)），并且該列表每季度更新一次，包含最近發(fā)布的變異 。此外，歐洲血友病和相關(guān)疾病協(xié)會(huì) ( EAHAD ) 在之前開發(fā)的數(shù)據(jù)庫(kù)的基礎(chǔ)上建立了一個(gè)項(xiàng)目，旨在收集涉及臨床出血性疾病的單基因變異數(shù)據(jù)庫(kù)，并為與止血相關(guān)的基因的 LSDB 提供單一門戶網(wǎng)站。迄今為止，EAHAD 凝血因子變異數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP/CHBMP 數(shù)據(jù)庫(kù)中已經(jīng)列出了 3000 多種導(dǎo)致血友病 A 的獨(dú)特致病變異和 1200 多種導(dǎo)致血友病 B 的獨(dú)特變異。這些數(shù)據(jù)庫(kù)包含有關(guān)其他 LSDB 中先前收錄的變異和文獻(xiàn)中新發(fā)表的變異的信息。 EAHAD 凝血因子變異數(shù)據(jù)庫(kù)還包括實(shí)驗(yàn)室直接提交的變異。然而，選擇性收錄可能會(huì)影響 CHAMP/CHBMP 和 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)中收錄的變異分布。此外，CHAMP/CHBMP 數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)以唯一變異列表的形式呈現(xiàn)，而不是由特定變異導(dǎo)致疾病的患者列表，而 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)允許雙向可視化數(shù)據(jù)。此外，作為血友病抑制劑致病基因鑒定基因解碼的一部分，CDC 對(duì) 1400 多名血友病 A 患者和 220 多名血友病 B 患者進(jìn)行了檢測(cè)，并在單獨(dú)的 Excel 文件（CHAMP/CHBMP 美國(guó) [US] 文件）中收錄了他們的變異結(jié)果。

PedNet（歐洲兒科血友病管理網(wǎng)絡(luò)）登記處是一個(gè)基于人群的前瞻性登記處，其中包括 2000 年 1 月 1 日后出生、在參與中心之一接受診斷、治療和隨訪的所有血友病兒童。在收集的所有變量中，包括F8/F9變體。

血友病致病基因鑒定基因解碼描述了血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)隊(duì)列中致病性F8/F9變異的全部譜系，并比較了該基于人群的譜系與 EAHAD 和 CHAMP/CHBMP 已建立的參考數(shù)據(jù)庫(kù)中發(fā)現(xiàn)的變異譜系的一致性。此外，血友病致病基因鑒定基因解碼還表明血友病基因檢測(cè)隊(duì)列的數(shù)據(jù)可作為未曾接受過治療的患者 (PUP) 致病基因鑒定基因解碼的參考。

血友病基因檢測(cè)大數(shù)據(jù)的收集

血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)基于對(duì) 2000 年 1 月 1 日以后出生的患有血友病 A 或血友病 B 的 PUP 的臨床、遺傳和表型數(shù)據(jù)的前瞻性收集，并在http://ClinicalTrials.gov上注冊(cè)，編號(hào)為NCT02979119。納入的患者是在來自 18 個(gè)國(guó)家/地區(qū)（歐洲、加拿大 [2 個(gè)中心] 和以色列 [1 個(gè)中心]）的 33 個(gè)合作血友病治療中心之一確診的。根據(jù)《赫爾辛基宣言》，每個(gè)中心都獲得了倫理批準(zhǔn)，并在納入登記處之前獲得了父母/看護(hù)人的書面知情同意。

血友病嚴(yán)重程度

在參與中心，至少兩次測(cè)量 FVIII/FIX 水平，采用顯色法或一步法測(cè)定，并確定血友病的嚴(yán)重程度。血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)遵循國(guó)際血友病分類，將 FVIII/FIX 分為重度血友病 (FVIII/FIX <1%) 和中度血友病 (FVIII/FIX, 1%–5%) 。對(duì)于輕度血友病，僅納入因子水平為 6%–25% 的患者。

基因分型和分類

基因分型由每個(gè)中心按照既定的常規(guī)在當(dāng)?shù)剡M(jìn)行，檢測(cè)倒位，主要使用桑格測(cè)序。近年來，一些中心已經(jīng)使用了下一代測(cè)序。提供給協(xié)調(diào)中心的所有基因收錄都根據(jù)人類基因組變異學(xué)會(huì)的建議進(jìn)行了檢查和修訂。此外，所有基因變異均采用美國(guó)醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)和基因組學(xué)學(xué)院和分子病理學(xué)協(xié)會(huì) (ACMG/AMP) 的標(biāo)準(zhǔn)和術(shù)語進(jìn)行分類。在大多數(shù)基因收錄中，只收錄了致病或可能致病的變異，但在某些情況下會(huì)收錄第二種變異，例如多態(tài)性。在本文中，只使用導(dǎo)致血友病 A 或血友病 B 的致病變異。

與CHAMP/CHBMP和EAHAD已建立的數(shù)據(jù)庫(kù)一致，PedNet數(shù)據(jù)庫(kù)采用以下分類：-

F8 中的變異類型為內(nèi)含子 22 倒位、內(nèi)含子 1 倒位、替換、缺失、重復(fù)、插入、多態(tài)性或復(fù)雜變異。-

F9 中的變異類型分為替換、缺失、重復(fù)、插入、多態(tài)性或復(fù)雜變異。

F8和F9 中將分子后果 (變異效應(yīng)) 分為錯(cuò)義、無義、移碼、大或小 (> 或 <50 個(gè)堿基對(duì)) 缺失/插入/重復(fù)、沉默變異、剪接位點(diǎn)變異、啟動(dòng)子變異、內(nèi)含子變異、多態(tài)性 (錯(cuò)義/剪接位點(diǎn)/沉默) 和倒位。

從血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)提取數(shù)據(jù)

對(duì)于當(dāng)前分析，數(shù)據(jù)提取于 2021 年 1 月 1 日進(jìn)行，包括血友病類型、嚴(yán)重程度、性別、家族史、變異類型和分子后果的信息。沒有已知血友病家族史的患者被視為散發(fā)病例。除內(nèi)含子 1 或內(nèi)含子 22 倒位外，具有變異效應(yīng)的患者被視為倒位陰性患者。

從 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP/CHBMP US 文件中提取數(shù)據(jù)

為了進(jìn)行比較，血友病致病基因鑒定基因解碼收集了國(guó)際血友病數(shù)據(jù)庫(kù) EAHAD 和 CHAMP/CHBMP 中有關(guān)重癥血友病的數(shù)據(jù)。在提取數(shù)據(jù)之前，血友病致病基因鑒定基因解碼聯(lián)系了 EAHAD 和 CHAMP/CHBMP 這兩個(gè)注冊(cè)中心，并允許使用公開數(shù)據(jù)。對(duì)于 CHAMP/CHBMP 注冊(cè)中心，血友病致病基因鑒定基因解碼使用了美國(guó)中心數(shù)據(jù)，因?yàn)檫@些數(shù)據(jù)是隊(duì)列收集的數(shù)據(jù)，而國(guó)際數(shù)據(jù)庫(kù)則包含每個(gè)發(fā)現(xiàn)的變體的數(shù)據(jù)。EAHAD 數(shù)據(jù)的提取日期為 2021 年 1 月 3 日。

血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)致病基因鑒定基因解碼人群和變異譜

在數(shù)據(jù)提取時(shí)，血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)中包括 2278 名男孩和 19 名女孩。在本致病基因鑒定基因解碼中，女性被排除在進(jìn)一步分析之外。1941 名患者 (85%) 的F8或F9變異信息可用：86% (1631/1904) 的血友病 A 患者和 83% (310/374) 的血友病 B 患者。在疾病嚴(yán)重程度方面，分別對(duì) 92%、77% 和 78% 的重度、中度和輕度血友病 A 患者進(jìn)行了基因分析，對(duì) 88%、84% 和 76% 的重度、中度和輕度血友病 B 患者進(jìn)行了基因分析。35 名血友病 A 患者和 5 名血友病 B 患者 (分別為 2% 和 1%) 未發(fā)現(xiàn)致病變異。 84% 的具有已知家族史的血友病 A 患者 ( n  = 898/1073 )、89% 的散發(fā)病例 ( n  = 696/786 ) 和 82% 的無家族史患者 ( n = 37/45 ) 接受了基因檢測(cè)。此外，80% 的具有已知家族史的血友病 B 患者 ( n =  187/234 )、88% 的散發(fā)病例 ( n  = 116/132 ) 和 88% 的無家族史患者 ( n =  7/8 ) 接受了基因檢測(cè) 。變異效應(yīng)的分布如圖所示表格1（針對(duì)血友病 A）和表 2（針對(duì)血友病 B）。

表1:患有血友病 A 的男孩在不同嚴(yán)重程度中變異效應(yīng)的分布

表中僅顯示具有已知變異的男性患者。數(shù)據(jù)以數(shù)字（百分比）的形式呈現(xiàn)。血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)注冊(cè)表中沒有關(guān)于種族的詳細(xì)信息。

表 2：患有血友病 B 的男孩在不同嚴(yán)重程度中變異效應(yīng)的分布

表中僅顯示具有已知變異的男性患者,數(shù)據(jù)以數(shù)字（百分比）形式呈現(xiàn)

血友病A 在 1170 名患有嚴(yán)重血友病 A 的患者中，1151 名（98%）被發(fā)現(xiàn)有致病變異。最常見的變異類型是內(nèi)含子 22 倒位，在 1151 名患者中發(fā)現(xiàn)有 597 名（52%）。內(nèi)含子 1 倒位發(fā)生在 17 名患者（1%）中。在非倒位患者（n  = 537）中，變異效應(yīng)包括 194 個(gè)移碼（36%；主要影響外顯子 14）、151 個(gè)錯(cuò)義（28%；主要影響外顯子 23 和 26）、110 個(gè)無義（21%；主要影響外顯子 14）和 38 個(gè)剪接位點(diǎn)變異（7%）、40 個(gè)大結(jié)構(gòu)變化（7%）、3 個(gè)小結(jié)構(gòu)變化（0.6%；在外顯子 15、22 和 24 中）和 1 個(gè)啟動(dòng)子變異（0.2%）。19 名患者（2%）的致病變異仍然未知。

在患有中度（ n  = 172）和輕度（n = 308）血友病 A 的患者中 ，錯(cuò)義變異是最常見的變異效應(yīng)，占中度病例的 157 例（91%）和輕度病例的 293 例（95%）。然而，盡管在中度血友病 A 患者中，這些變異幾乎平均分布在 A1（19%）、A2（23%）、A3（21%）和 C1（21%）域之間，但在輕度血友病 A 患者中，它們最常位于 A2 域（40%）（圖1A）。

中度和輕度血友病中錯(cuò)義變異的位置。（A）根據(jù)中度或輕度血友病 A 中的因子 VIII 蛋白結(jié)構(gòu)域進(jìn)行定位；（B）根據(jù)中度或輕度血友病 B 中的因子 IX 蛋白結(jié)構(gòu)進(jìn)行定位。GLA：c-羧基谷氨酸結(jié)構(gòu)域；EGF：表皮生長(zhǎng)因子樣結(jié)構(gòu)域；ACT-Peptide：活化肽

血友病B 在重度血友病 B 患者 ( n  = 160 ) 中，最常見的變異類型是致病點(diǎn)突變 ( n  = 123；77%)，根據(jù)變異效應(yīng)分層時(shí)，血友病致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn)大多是錯(cuò)義變異 ( n  = 77；48%) 和無義變異 ( n  = 34；21%)。此外，還發(fā)現(xiàn)了大的結(jié)構(gòu)變化 ( n  = 18；11%)、移碼變異 ( n  = 14；9%)、啟動(dòng)子和剪接位點(diǎn)變異 ( n  = 7；各 4%) 以及小的結(jié)構(gòu)變化 ( n  = 3；2%)。在一名患者中未發(fā)現(xiàn)致病變異。遺傳變異遍布整個(gè)F9。

在中度 ( n  = 79) 和輕度 ( n  = 71) 血友病 B 中，錯(cuò)義變異在大多數(shù)患者中都代表了致病變異效應(yīng)：68 例中度病例和 61 例輕度病例（各占 86%）。與血友病 A 一樣，這些變異的分布在中度和輕度血友病 B 之間有所不同。兩組中的大多數(shù)錯(cuò)義變異都發(fā)生在絲氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域中（中度血友病 B 為 51%，輕度血友病 B 為 60%）。然而，輕度血友病 B 與 EGF1 結(jié)構(gòu)域中的變異更常見，而前肽或連接子中的變異則較少發(fā)現(xiàn)（圖1B). 血友病B患者的重鏈和輕鏈之間錯(cuò)義變異的分布非常相似。

此外，據(jù)報(bào)道， F9啟動(dòng)子中的 16/17 (94%) 個(gè)變體與血友病 B 萊登表型有關(guān)。

根據(jù)家族史劃分的血友病基因檢測(cè)隊(duì)列變異譜

血友病致病基因鑒定基因解碼還比較了血友病基因檢測(cè)隊(duì)列中重度血友病散發(fā)病例和已知家族史病例的變異效應(yīng)分布。重度血友病散發(fā)病例中的錯(cuò)義變異明顯較少（61/614（10%），而已知家族史病例中為 87/515（17%）；p=0.0007）。相比之下，根據(jù)家族史，重度血友病 B 患者的變異效應(yīng)分布沒有顯著差異。

與 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP/CHBMP 文件比較的變異譜

在血友病致病基因鑒定基因解碼致病基因鑒定基因解碼的這一部分中，血友病致病基因鑒定基因解碼將分析限制在患有嚴(yán)重血友病的患者身上。

血友病 A EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)未列出F8倒位。它包含 4691 名嚴(yán)重、倒位陰性的血友病 A 患者的分子信息。這些患者中最常見的變異效應(yīng)是移碼 ( n  = 1487；32%)、錯(cuò)義 ( n  = 1418；30%) 和無義變異 ( n  = 966；21%)，其次是剪接位點(diǎn)變異和大的結(jié)構(gòu)變化。

美國(guó)隊(duì)列包括 668 名患有嚴(yán)重血友病 A 的患者，其中 288 名 (43%) 有內(nèi)含子 22 倒位，11 名 (2%) 有內(nèi)含子 1 倒位；15 名患者 (2%) 未發(fā)現(xiàn)致病變異。在倒位陰性患者中，最主要的變異效應(yīng)是移碼 ( n  = 108；31%)、錯(cuò)義 ( n  = 100；28%) 和無義變異 ( n  = 79；22%)，其次是大的結(jié)構(gòu)變化 ( n  = 42；12%)。

對(duì)于血友病基因檢測(cè)隊(duì)列與 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP/CHBMP US 文件的比較，僅包括重度血友病 A 的倒置陰性患者。數(shù)據(jù)庫(kù)中重度血友病 A 的倒置陰性患者的頻譜幾乎相同（圖 2）。

圖 2：血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)隊(duì)列中的變異效應(yīng)譜與 CHAMP/CHBMP 美國(guó)文件和 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)的比較。 (A) 患有嚴(yán)重血友病 A 的反轉(zhuǎn)陰性患者；(B) 重度血友病 B 患者。數(shù)據(jù)以百分比表示。

血友病B 在 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)納入的 3823 名嚴(yán)重血友病 B 患者中，錯(cuò)義變異（n  = 2609；68%）是最常見的變異效應(yīng)；在 592 名（15%）嚴(yán)重血友病 B 患者中，無義變異代表了致病變異效應(yīng)。

在美國(guó)隊(duì)列中，87 名嚴(yán)重血友病 B 患者中，錯(cuò)義變異（n  = 40；46%）占變異效應(yīng)的近一半，而 19 名患者（22%）出現(xiàn)無義變異。

將血友病基因檢測(cè)隊(duì)列與 EAHAD 和 CHBMP 數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比較，錯(cuò)義變異是每個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中最普遍的變異效應(yīng)（圖 2）。

血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)總結(jié)

血友病致病基因鑒定基因解碼收錄了血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)注冊(cè)表中 1941 名患有血友病 A 或血友病 B 的人群隊(duì)列中的F8/F9變異，并提出使用該數(shù)據(jù)庫(kù)作為已建立的 LSDB 的替代方案。

首先，血友病致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn) 50% 的嚴(yán)重血友病 A 患者有內(nèi)含子 22 倒位，而 CHAMP-US 隊(duì)列中這一比例為 43%，普遍接受的患病率約為 45% 。然而，血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)隊(duì)列是第一個(gè)提供內(nèi)含子 22 倒位患病率數(shù)據(jù)的大型人群隊(duì)列，因此應(yīng)被視為額外的基準(zhǔn)。此外，在血友病基因檢測(cè)隊(duì)列和 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP-US 文件中，倒位陰性的嚴(yán)重血友病 A 患者的變異效應(yīng)分布非常相似：移碼、錯(cuò)義和無義變異是這些患者中最常見的變異效應(yīng)。在嚴(yán)重血友病 B 患者中，錯(cuò)義變異最為常見，這一發(fā)現(xiàn)與其他數(shù)據(jù)庫(kù)再次具有可比性。

接下來，血友病致病基因鑒定基因解碼致病基因鑒定基因解碼了非重度血友病患者中變異的分布情況。雖然錯(cuò)義變異是中度和輕度血友病患者中最常見的變異效應(yīng)，但血友病致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn)它們的位置因疾病的嚴(yán)重程度而異。事實(shí)上，與輕度血友病 A 相關(guān)的錯(cuò)義變異最常位于 A2 域，而在中度病例中，這些錯(cuò)義變異更均勻地分布在 A1、A2、A3 和 C1 域之間。因此，輕度血友病 A 患者的重鏈?zhǔn)苡绊懙目赡苄员戎卸妊巡?A 患者更大。對(duì)于血友病 B，輕度血友病 B 中的變異在 EGF1 結(jié)構(gòu)域中出現(xiàn)的頻率高于中度血友病 B，但在前肽和連接子中出現(xiàn)的頻率低于中度血友病 B。變異對(duì) FVIII 或 FIX 蛋白結(jié)構(gòu)的影響以及因此對(duì)疾病嚴(yán)重程度的影響是當(dāng)前致病基因鑒定基因解碼的課題，并且有證據(jù)表明，表型變異也可能與變異發(fā)生的區(qū)域有關(guān)。 然而，變異位置的作用值得進(jìn)一步探索。

此外，在血友病致病基因鑒定基因解碼 2% 的血友病 A 患者和 1% 的血友病 B 患者的相應(yīng)基因中未鑒定出致病變異，這與 CHAMP 數(shù)據(jù)和一些收錄相當(dāng)，但與其他致病基因鑒定基因解碼相比較低，其他致病基因鑒定基因解碼未能在多達(dá) 11% 的患者中鑒定出致病變異。值得注意的是，基因檢測(cè)的最新發(fā)展提高了變異檢測(cè)能力，這可能解釋了不同致病基因鑒定基因解碼之間的差異。

此外，血友病致病基因鑒定基因解碼還評(píng)估了嚴(yán)重血友病的變異譜是否因家族史而不同。有趣的是，錯(cuò)義變異在嚴(yán)重血友病 A 的散發(fā)病例中不太常見，而在嚴(yán)重血友病 B 患者中沒有差異。致病基因鑒定基因解碼的致病基因鑒定基因解碼收錄了血友病 B 患者的類似結(jié)果，但散發(fā)性和家族性病例譜的比較尚未得到廣泛致病基因鑒定基因解碼。請(qǐng)注意，血友病致病基因鑒定基因解碼隊(duì)列中散發(fā)病例的定義是基于家族中缺乏其他有癥狀/診斷的病例，而不是基于患者母親的基因測(cè)試結(jié)果。重要的是，血友病 B 的單倍型分析表明，特別是在輕度疾病中，看似散發(fā)的病例可能在無人知曉的情況下存在相關(guān)性，這可能會(huì)影響血友病致病基因鑒定基因解碼的觀察結(jié)果。

最后，鑒于抑制劑的發(fā)展，擁有正確的變異譜框架來解釋 PUP 致病基因鑒定基因解碼結(jié)果（鑒于其代表血友病人群）極其重要。目前使用三種 LSDB：CHAMP（F8變異）、CHBMP（F9變異）和 EAHAD 凝血因子變異數(shù)據(jù)庫(kù)（F8和F9變異）。這些數(shù)據(jù)庫(kù)的發(fā)展大大提高了有關(guān)基因內(nèi)變異位置、相關(guān)疾病嚴(yán)重程度和抑制劑發(fā)展風(fēng)險(xiǎn)的信息的可訪問性。此外，這些數(shù)據(jù)庫(kù)中描述的所有變異都符合人類基因組變異學(xué)會(huì)指南的通用命名法。然而，這些 LSDB 有一些局限性。首先，它們是從以前的 LSDB 或中央突變數(shù)據(jù)庫(kù)開始構(gòu)建的，并通過文獻(xiàn)搜索或通過各個(gè)實(shí)驗(yàn)室或致病基因鑒定基因解碼人員提交發(fā)現(xiàn)的變異進(jìn)行補(bǔ)充和更新。因此，收錄偏差會(huì)影響其準(zhǔn)確性和完整性。其次，CHAMP/CHMBP 突變列表是變異的列表。由于它們沒有表明由特定變異引起疾病的患者數(shù)量，因此無法基于這些數(shù)據(jù)將變異的頻率推斷為受該變異影響的患者的頻率。事實(shí)上，CHAMP 突變列表只包括 2 個(gè)倒位列表（即內(nèi)含子 1 倒位和內(nèi)含子 22 倒位），盡管超過 40% 的嚴(yán)重血友病 A 病例是由倒位引起的。相反，在 CHAMP/CHBMP US 文件中，每一行都對(duì)應(yīng)于基于人群的血友病抑制劑致病基因鑒定基因解碼調(diào)查員中包括的一名患者。最后，F(xiàn)8倒位未在 EAHAD 數(shù)據(jù)庫(kù)中列出。在這項(xiàng)致病基因鑒定基因解碼中，血友病致病基因鑒定基因解碼收錄了多中心大型基于人群的血友病 A 或 B 型 PUP 隊(duì)列中的全部F8/F9變異譜。因此，盡管數(shù)據(jù)庫(kù)本身并非免費(fèi)訪問，但此處介紹的變異譜可以作為基于人群的參考，并且可能在未來的致病基因鑒定基因解碼中有用。

血友病致病基因鑒定基因解碼的致病基因鑒定基因解碼有一些局限性。首先，血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)僅收集 18 歲以下患者的數(shù)據(jù)。此外，輕度血友病且 FVIII 或 FIX 水平高于 25% 的患者未被納入。因此，輕度血友病和/或不太嚴(yán)重表型的患者可能代表性不足，尤其是在沒有已知家族史的情況下。然而，2001 年和 2014 年，國(guó)際血栓和止血學(xué)會(huì)科學(xué)和標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)第 VIII 因子和第 IX 因子及罕見凝血障礙科學(xué)小組委員會(huì)建議，如果血漿 FVIII 或 FIX 水平在 5% 至 40% 之間，則將血友病歸類為輕度。因此，EAHAD 凝血因子變異數(shù)據(jù)庫(kù)和 CHAMP/CHBMP US 文件可能包括 FVIII 或 FIX 水平在 25% 至 40% 之間的輕度血友病患者，而血友病基因檢測(cè)注冊(cè)表則不包括。其次，血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)注冊(cè)表中包括一些患有血友病的女性，但她們很可能并不代表所有患有血友病的女性患者。因此，本致病基因鑒定基因解碼未分析女性數(shù)據(jù)。此外，沒有關(guān)于種族的詳細(xì)信息，雖然血友病致病基因鑒定基因解碼納入了來自歐洲、加拿大和以色列的患者，但一些族群可能代表性不足。此外，血友病致病基因鑒定基因解碼沒有收錄第二種變異。雖然 2 種致病變異可能很少見且臨床意義仍未解決，但對(duì)于已知致病變異但表型不尋常的患者，以及在遺傳咨詢環(huán)境中，都應(yīng)考慮它們。最后，有些患者尚未進(jìn)行基因分析。重度血友病 A 和重度或中度血友病 B 患者接受檢測(cè)的可能性更大，但有已知家族病史的重度血友病 A 患者接受基因檢測(cè)的頻率較低，這很可能是因?yàn)橹虏∽儺愐呀?jīng)為人所知。然而，除非患者本人確認(rèn)，否則血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)不允許收錄變異。這可能導(dǎo)致血友病致病基因鑒定基因解碼的數(shù)據(jù)出現(xiàn)偏差。

總之，血友病基因檢測(cè)數(shù)據(jù)庫(kù)人群隊(duì)列為通過選擇性收錄收集數(shù)據(jù)的現(xiàn)有數(shù)據(jù)庫(kù)提供了一種替代方案，因?yàn)樗且粋€(gè)維護(hù)良好的數(shù)據(jù)庫(kù)，涵蓋了所有致病F8和F9變異，并指示了受每種特定變異影響的患者數(shù)量。