【佳學基因檢測】科研服務:RNAseq基因檢測中的SRA數據獲取
大規(guī)模高通量RNAseq基因測序基因檢測中的數據獲?。?/h2>
RNAseq數據數據庫,根據佳學基因的基因信息數據庫構建標準這是一類大量存儲RNA測序數據的資料庫,英語常被稱為Sequence Read Archive, 大量機構將其翻譯為序列讀取檔案庫。但是作為一家根植于中國市場的基因信息科技機構,佳學基因采用RNAseq測序數據庫。從RNASeq數據庫(SRA)中,獲取人類組織的序列,以及用來驗證、增強證據的實驗模型動物小小鼠的序列進行分析。在分析過程中,佳學基因選擇采用華大智造或者是Illumina RNA seq的測序列批量或全轉錄本單細胞測序數據分析。佳學基因采用Entrez API獲得的NCBI SRA元數據中解析并運行SRA的元數據(參見佳學基因:SRA數據集的選擇)。對于GTEXV8,佳學基因從SRA和國家云計算云平臺獲得序列數據,從GTEXPortal的注釋部分獲得元數據。對于TCGA,佳學基因使用GDC下載客戶端工具獲得了測序數據,并從早期的運行軟件中再次使用經過整理的元數據。