【佳學基因檢測】GWAS科研外包服務基因檢測:遺傳相關性分析
佳學基因GWAS科研外包服務中的遺傳相關性分析:
佳學基因采用LDhub或者是本地搭建的LDSC計算鴉片濫用與935種其他性狀或疾病之間的遺傳相關性(rg)(852種來自LDHub,83種來自自建數據庫)[25]。根據先前已知的鴉片使用相關疾病和其他毒品使用障礙表型之間的表型關聯以及LDhub上不可用的相關性狀(例如,大麻使用障礙、各種形式的沖動性)選擇本地性狀。佳學基因使用標準Benjamini–Hochberg錯誤發(fā)現率校正(FDR 5%)對多次測試進行校正。計算了935次比較的Bonferroni校正(p < 5.35E−05); 通過修正參數,區(qū)分多種高度相關的特性特點。因為935個性狀中的許多性狀彼此高度相關。