【佳學基因檢測】MSI基因檢測
什么是MSI基因檢測？
微衛(wèi)星（MS）又稱為短串聯(lián)重復序列（STRs）或簡單序列重復序列（SSRs），由1-6個核苷酸的重復序列組成。小衛(wèi)星DNA的分布特征不同于15～65個核苷酸串聯(lián)重復序列，主要位于染色體末端附近。MS分布廣泛，大多位于編碼區(qū)附近，也可能位于其他區(qū)域，如內(nèi)含子或非編碼區(qū)。每個MS特異位點由中心核和外圍側(cè)翼兩部分組成，MS的特異性主要是由于核心重復單元數(shù)目的變化。
MS的產(chǎn)生機制一般認為是DNA復制過程中的滑移，或DNA復制和修復過程中滑移鏈和互補鏈的堿基錯配，導致一個或多個重復單元缺失或插入。正常組織DNA修復系統(tǒng)稱為錯配修復（MMR），可以糾正DNA復制過程中的錯誤。然而，由于腫瘤細胞中MMR基因的缺失或復制修復過程中的缺陷，基因突變的可能性增加?？梢奙SI是腫瘤發(fā)生發(fā)展的重要因素。
根據(jù)微衛(wèi)星不穩(wěn)定性的發(fā)生頻率，可分為高微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI-H）、低微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（MSI-L）和微衛(wèi)星穩(wěn)定性（MSS）。目前臨床研究傾向于將MSS-L和MSS歸為一類。根據(jù)MSI在結(jié)直腸癌中的不同分子機制，可分為無明顯家族遺傳史的結(jié)直腸癌（CRC）和有家族遺傳史的非息肉病Lynch綜合征?；蚪獯a早期發(fā)現(xiàn)，MSI病例多為散發(fā)性結(jié)直腸癌，其原因是由于hMLH1啟動子甲基化導致后代基因表達表觀失活而未發(fā)生基因突變。Lynch綜合征是一種由MMR株突變引起的常染色體顯性腫瘤綜合征，它也可以引起結(jié)腸和直腸其他部位的腫瘤。
由于MSI早期檢測的局限性和MSI早期機制的不明確，目前只能用一些特異性化療藥物治療MSI患者，效果并不理想。隨著MSI檢測技術和免疫抑制劑在腫瘤治療中的應用，研究人員發(fā)現(xiàn)MSI-H腫瘤對免疫治療反應良好。FDA批準PD-L1（程序性細胞死亡配體1）阻斷Keytruda治療MSI-H/MMR患者。學者們開始對MSI的檢測方法、MSI的機制以及MSI與腫瘤的關系等方面進行更深入的研究。
微衛(wèi)星不穩(wěn)定性檢測（MSI)方法及進展
隨著人類基因組計劃的實施，科學家們開始進一步研究與人類疾病相關的基因，發(fā)現(xiàn)與之相關的微衛(wèi)星不穩(wěn)定性，并尋求檢測相關方法（表1）。MSI(微衛(wèi)星不穩(wěn)定性（檢測方法一覽表
| 檢測方法 | 特點 | 檢測對象 | 檢測精度 |
|---|---|---|---|
| NGS | 少量樣本可以得到正確結(jié)果 | 同乎 100 MS 位點 |
IMPACT™: 92% F1CDx: 94.6% |
| 多重滎光PCR and CE |
只能得到MSI結(jié)果 MSI 分析系統(tǒng)是基于這一方法 |
5 MS sites: BAT-26, NR-21, BAT-25, MONO-27 and NR-24 | Gold standard, 100% |
| IHC | 應用廣泛，實用性強，但是只能得到MMR結(jié)果 | The MMR protein: hMLH1, hPMS2, hMSH2, hMSH6 | 89–95% |
| smMIPs | Accurate and no matching of normal materials are required for certain diseases: colorectal cancer, prostate cancer, endometrial cancer | DNA from tumor tissue | 95.80% |
NGS next-generation sequencing, PCR polymerase chain reaction, CE capillary electrophoresis, IHC immunohistochemistry, smMIPs single-molecule molecular inversion probes, MMR mismatch repair, MS microsatellite
(責任編輯：佳學基因)
