【佳學(xué)基因檢測】人的外表中的牙齒異基因檢測及其科學(xué)依據(jù)
基因解碼基因檢測在揭示綜合征性缺牙(TA)的遺傳學(xué)方面取得了顯著進(jìn)展,最常見的孤立性缺牙的病因?qū)τ跀?shù)據(jù)庫比對來說仍然困難?;蚪獯a已確定了一些新的基因和變異,揭示了牙齒發(fā)育過程中相關(guān)基因的新途徑。此外,隨著新一代測序等新研究方法的應(yīng)用,基因解碼基因檢測進(jìn)一步為缺牙的寡基因遺傳模型提供了更多證據(jù),這有助于解釋該病的表型變異性。在《人體的基因序列變化與疾病表征》中,佳學(xué)基因介紹目前有關(guān)人類綜合征性和孤立性缺牙的遺傳機(jī)制,并強(qiáng)調(diào)結(jié)合新一代測序方法識別致病基因和修飾基因的價值。
關(guān)鍵詞:缺牙,病因,基因,遺傳
1. 牙齒基因檢測的遺傳學(xué)基礎(chǔ)導(dǎo)讀
牙齒發(fā)育需要口腔上皮與神經(jīng)嵴衍生的間充質(zhì)之間的多次信號相互作用,并受到多種信號分子及其下游信號通路的精確控制。這些信號相互作用使得牙齒能夠形成具有高度特化結(jié)構(gòu)的不同類型的牙齒,如門牙、犬齒、前磨牙和臼齒。任何發(fā)育過程中的干擾都可能影響牙齒的生長、分化與模式形成。
牙齒發(fā)育不全(TA)是指由于牙齒發(fā)育過程中受到干擾,導(dǎo)致一顆或多顆恒牙先天性缺失。TA 是最常見的牙齒發(fā)育異常,并且可能是約150種綜合征的標(biāo)志性表現(xiàn),雖然它也可獨(dú)立存在,偶爾發(fā)生或家族遺傳。TA 的遺傳模式包括常染色體顯性、常染色體隱性或X連鎖,表現(xiàn)出明顯的滲透力和表現(xiàn)度差異。根據(jù)缺失牙齒數(shù)量,TA 被分為牙發(fā)育不全(缺失不超過5顆牙齒)或少牙(缺失6顆及以上牙齒)。如果所有恒牙缺失,則稱為無牙,通常與TA的綜合征形式相關(guān)。
TA的發(fā)生率存在顯著差異,并且在不同性別和種族群體中表現(xiàn)出不同的患病率。研究顯示,單顆牙齒缺失的患病率為3%至10%,而少牙的患病率較低,僅為0.1%至0.5%(不包括第三磨牙)。若包括第三磨牙,患病率則可高達(dá)25%。最常見的缺失牙齒包括下頜第二恒牙、上頜側(cè)門牙和上頜第二恒牙。女性較男性更易發(fā)生TA,比例為3:2。
TA的發(fā)病偶爾與外部因素相關(guān),如感染、創(chuàng)傷、化療或放療,但大多數(shù)情況下與遺傳因素密切相關(guān)。研究表明,牙齒的發(fā)育過程受到嚴(yán)格的基因控制,這些基因決定了牙齒的數(shù)量、形狀和位置。多年來,通過轉(zhuǎn)基因動物研究,我們獲得了功能數(shù)據(jù),證明骨形態(tài)發(fā)生蛋白(BMP)、成纖維生長因子(FGF)、音猬因子(SHH)和WNT信號通路的基因突變會導(dǎo)致牙齒發(fā)育異常,從牙齒形態(tài)缺陷到牙齒發(fā)育完全停止。
目前,已有多種基因突變被認(rèn)為是TA的致病因素。然而,已知的突變僅能解釋部分病例,因此關(guān)于TA的潛在分子機(jī)制仍有許多未知領(lǐng)域。最近,表觀遺傳調(diào)控也被認(rèn)為在TA的發(fā)生中發(fā)揮重要作用。此外,新一代測序等先進(jìn)技術(shù)的出現(xiàn),為識別新型TA基因和變異提供了有力支持,也揭示了這些遺傳缺陷的潛在病因。
2. 牙齒缺失的遺傳基礎(chǔ)
2.1 與牙齒發(fā)育不全相關(guān)的綜合征
TA常常作為約150種綜合征的一部分出現(xiàn)。這些綜合征通常與口面部裂隙綜合征和外胚層發(fā)育不良綜合征相關(guān)。由于牙齒發(fā)育與其他外胚層器官的發(fā)育機(jī)制相似,參與牙齒發(fā)育的基因往往也在其他器官的發(fā)育過程中發(fā)揮作用。表1總結(jié)了與TA相關(guān)的綜合征形式及其病因基因。
表 1.與綜合征牙缺失及相關(guān)表型有關(guān)的基因。
基因/位點(diǎn)
|
OMIM | 染色體 | 綜合癥 | 遺傳方式 | 牙齒/口腔表型 | 動物模型 | 動物模型表型 |
ADAMTS2 | 604539 | 5q35.3 | 埃勒斯-丹洛斯綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒缺失、小牙、牙齒變色 | 牛模型 | 皮膚孢子病表型類似于 EDS VII C 型 |
ANTXR1 | 606410 | 2p13.3 | 生長遲緩、脫發(fā)、假性無牙癥和視神經(jīng)萎縮 (GAPO) 綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全,萌出延遲 | 是的 | 生長遲緩、骨質(zhì)流失、頭骨縮短、額骨凸起、中面部發(fā)育不全 |
AXIN2 | 604025 | 17q24.1 | 少牙-結(jié)直腸癌綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 少牙癥 | 是的 | 顱骨形態(tài)異常 |
COL1A1/2 | 120150 | 17q21.33 | 成骨不全癥 1 型 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒缺失、少牙 | 是的 | 致命、骨折 |
CREBBP | 600140 | 16p13.3 | 魯賓斯坦-泰比綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、下頜后縮、小頜畸形、腭弓/窄腭、爪尖、牙齒擁擠、螺絲刀門牙、交叉咬合和牙釉質(zhì)發(fā)育不全 | 是的 | 骨骼畸形 |
EDA | 300451 | Xq13.1 | 外胚層發(fā)育不良,少汗癥 | 性連鎖隱性遺傳 | 無牙癥、牙齒發(fā)育不全、牙齒畸形、小牙癥 | 是犬 | 不完整的錐形牙齒 |
EDAR | 604095 | 2季度13 | 外胚層發(fā)育不良,少汗/毛發(fā)/牙齒型 | 常染色體隱性遺傳 | 無牙、缺牙、少牙 | 小鼠模型 | 臼齒數(shù)量減少、門牙小、臼齒小、釉質(zhì)結(jié)形態(tài)異常 |
EDARADD | 606603 | 1q42-q43 | 外胚層發(fā)育不良,少汗/毛發(fā)/牙齒型 | 常染色體顯性遺傳 | 無牙癥、缺牙癥、牛牙癥、小牙癥 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常,臼齒數(shù)量減少,臼齒小,牙釉質(zhì)形態(tài)異常 |
EVC | 604831 | 4p16.2 | Ellis-van Creveld 綜合征和 Weyers 肢端骨發(fā)育不全 | 常染色體隱性遺傳/常染色體隱性遺傳 | 原生牙、牙釉質(zhì)異常、牙齒缺失、小牙畸形 | 小鼠模型 | 牙釉質(zhì)缺陷、牙齒形態(tài)異常 |
EVC2 | 607261 | 4p16.2 | Ellis-van Creveld 綜合征和 Weyers 肢端骨發(fā)育不全 | 常染色體隱性遺傳/常染色體隱性遺傳 | 原生牙齒、牙釉質(zhì)異常、牙齒缺失、少牙、小牙 | 小鼠模型 | 小牙畸形,上門牙較小,顱骨較小 |
FGF10 | 602115 | 5p12 | 淚耳齒指綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全(上頜門牙)、小牙畸形、延遲萌出、牙釉質(zhì)發(fā)育不良 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常,門牙短,臼齒小,腭發(fā)育異常,舌頭形態(tài)異常 |
FGFR1 | 136350 | 8p11.23 | 卡爾曼綜合征 | 卡儂座 | 牙齒發(fā)育不全、唇裂/腭裂 | 小鼠模型 | 顱骨形態(tài)異常、面部不對稱、門牙過長 |
FGFR2 | 176943 | 10q26.13 | 淚耳齒指綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全(上頜門牙)、小牙畸形、萌出延遲、牙釉質(zhì)發(fā)育不良 | 小鼠模型 | 牙齒發(fā)育停滯、門牙過長、臼齒數(shù)量減少、小頜畸形 |
Apert 綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全(上頜犬齒)、牙釉質(zhì)混濁、異位萌出、牙齦增生 | 小鼠模型 | 牙齒發(fā)育停滯、門牙過長、臼齒數(shù)量減少、小頜畸形 | |||
FGFR3 | 134934 | 4p16.3 | 伴有黑棘皮癥的 Crouzon 綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、錯頜畸形、牙骨質(zhì)瘤、牙齒萌出延遲、中面部發(fā)育不全 | 小鼠模型 | 牙齒錯位、門牙過長、咬合不正、下頜突出、上頜后縮 |
FLNB | 603381 | 3p14.3 | Larsen 綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育遲緩、牙齒發(fā)育遲緩、3 類咬合、形態(tài)異常 | 小鼠模型 | 顱骨形態(tài)異常 |
FOXC1 | 601090 | 6p25.3 | Axenfeld–Rieger 綜合征 3 型 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒缺失、小牙畸形、牛牙畸形 | 小鼠模型 | 下頜骨短 |
GJA1 | 121014 | 6q22.31 | 眼牙指發(fā)育不良 | AD、AR | 小牙畸形、牙釉質(zhì)發(fā)育不全、牙齒發(fā)育不良、牙齒萌出延遲 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常、小牙畸形、上下頜骨小、牙釉質(zhì)厚度減少 |
GRHL2 | 608576 | 8q22.3 | 外胚層發(fā)育不良/身材矮小綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒萌出延遲、牙齒發(fā)育不全、牙釉質(zhì)發(fā)育不全 | 小鼠模型 | 顱骨形態(tài)異常、面部和中線裂隙 |
IRF6 | 607199 | 1q32.2 | 范德沃德綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、唇裂/腭裂 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常、腭部發(fā)育異常、下頜骨較小 |
JAG1 | 601920 | 20p12.2 | 阿拉吉爾綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、牙釉質(zhì)發(fā)育不全和混濁、礦化不足 | 小鼠模型 | 上頜骨短、咬合不正、腭形態(tài)異常 |
KDM6A | 300128 | Xp11.3 | 歌舞伎綜合癥2 | XLR | 高腭弓、錯頜畸形、小牙畸形、小牙弓、牙齒缺失、嚴(yán)重上頜骨萎縮、錐形牙齒 | 小鼠模型 | 顱裂 |
KMT2D | 602113 | 12q13.12 | 歌舞伎癥候群1 | 常染色體顯性遺傳 | 高腭弓、錯頜畸形、小牙畸形、小牙弓、牙齒缺失、嚴(yán)重上頜后縮、錐形牙齒 | 小鼠模型 | 上頜骨短,吻部扁平 |
KREMEN1 | 609898 | 22q12.1 | 外胚層發(fā)育不良,毛發(fā)/牙齒類型 | 常染色體隱性遺傳 | 少牙、牙齒發(fā)育不全、牙槽嵴缺失、腭深度增加 | 是的 | 無顱面表型 |
MKKS | 604896 | 20p12.2 | Bardet-Biedl 綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒擁擠、高腭弓、牙齒發(fā)育不全、錯頜畸形、牙釉質(zhì)發(fā)育不全、下頜后縮 | 小鼠模型 | 嗅覺上皮異常 |
MSX1 | 142983 | 4p16.1 | Witkop 綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒缺失、少牙 | 小鼠模型 | 牙齒發(fā)育停滯、指甲床和指甲板缺陷、腭裂 |
NEMO | 300248 | Xq28 | 色素失調(diào)癥 | 西洋參 | 缺牙、無牙、小牙 | 小鼠模型 | 無顱面表型 |
NSD1 | 606681 | 5q35.3 | Sotos 綜合征 I | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、牙釉質(zhì)缺損、錯頜畸形 | 小鼠模型 | 無顱面表型 |
OFD1 | 300170 | 2.2 | 口面指綜合征I | 性連鎖遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、側(cè)門牙缺失、犬齒錯位、小頜畸形 | 是的 | 初級纖毛形成然后消失,腎囊腫 |
P63 | 603273 | 3q28 | 頜面裂 8、拉普-霍奇金畸形、缺指癥、外胚層發(fā)育不良和唇腭裂綜合征 3 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、牙釉質(zhì)發(fā)育不全、廣泛齲齒、下頜尖牙發(fā)育不全、普遍性小牙畸形、上頜恒切牙邊緣脊突出、恒磨牙呈圓形、上頜恒中切牙呈桶狀 | 小鼠模型 | 牙齒發(fā)育停滯、上下頜骨小、顱面發(fā)育異常、腭裂 |
PITX2 | 601542 | 4q25 | Axenfeld–Rieger 綜合征 1 型 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、小牙畸形、牙釉質(zhì)發(fā)育不全 | 小鼠模型 | 上頜骨和下頜骨形態(tài)異常,牙齒發(fā)育停滯 |
PVRL1 | 600644 | 11q23.3 | 唇腭裂-外胚層發(fā)育不良 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒缺失、唇腭裂、牙齒形態(tài)異常、小牙畸形 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常 |
RECQL4 | 603780 | 8q24.3 | 羅斯蒙德-湯姆森綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、小牙、牙齒發(fā)育不全 | 小鼠模型 | 牙齒萌出延遲、腭裂 |
RSK2 | 300075 | Xp22.12 | Coffin–Lowry 綜合征 | 性連鎖遺傳 | 高窄腭、中線舌溝、牙齒缺失和小牙畸形 | 小鼠模型 | 牙齒形態(tài)異常、多生牙 |
SHH | 600725 | 7q36.3 | 全前腦畸形 | 常染色體顯性遺傳 | 唇腭裂、單中央門牙、小頜畸形 | 是的 | 牙齒形態(tài)異常、小牙畸形 |
TBX3 | 601621 | 12q24.21 | 尺乳綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒發(fā)育不全、犬齒異位和發(fā)育不全 | 是的 | 繼發(fā)性腭裂 |
TCOF1 | 606847 | 5q32-q33 | 特雷徹·柯林斯綜合征 | 常染色體顯性遺傳 | 牙齒缺失、小頜畸形、錯頜畸形、牙齒間隙 | 是的 | 下頜骨和上頜骨較短 |
TFAP2B | 601601 | 6p12.3 | 炭疽病 | 常染色體顯性遺傳 | 少牙、牙齒發(fā)育不全、厚嘴唇、乳牙滯留 | 是的 | 無顱面表型 |
TFAP2B | 190685 | 21q22.13 | 唐氏綜合癥 | 零星病例 | 牙齒發(fā)育不全,萌出延遲,上頜中切牙呈桶狀 | 是的 | 全身發(fā)育不全和發(fā)育遲緩、腎積水、心臟和神經(jīng)系統(tǒng)缺陷 |
TFAP2B | 612920 | 21q22.3 | 外胚層發(fā)育不良 | 常染色體隱性遺傳 | 牙齒缺失、小牙 | 是的 | 無顱面表型 |
UBR1 | 605981 | 15q15.2 | 約翰遜-暴風(fēng)雪綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 少牙癥 | 是的 | 無顱面表型 |
WNT10A | 606268 | 2q35 | 牙髓發(fā)育不良 | 常染色體隱性遺傳 | 少牙癥、牙齒缺失癥、小牙癥 | 是的 | 磨牙發(fā)育停滯、多生磨牙、牙齒形態(tài)異常 |
肖普夫-舒爾茨-帕薩格綜合征 | 常染色體隱性遺傳 | 少牙癥、牙齒缺失癥、小牙癥 | 是的 | 磨牙發(fā)育停滯、多生磨牙、牙齒形態(tài)異常 |
OMIM,人類在線孟德爾遺傳(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/omim/)AR,常染色體隱性遺傳;AD,常染色體顯性遺傳;XLD,x 連鎖顯性遺傳;XLR,x 連鎖隱性遺傳;IC,孤立病例。
2.1.1. 外胚層發(fā)育不良綜合征
外胚層發(fā)育不良 (ED) 是一類表現(xiàn)為皮膚、毛發(fā)、指甲、牙齒、外分泌腺和皮脂腺等多個系統(tǒng)缺陷的疾病。已有研究揭示了由不同基因突變引起的各種ED類型,其中X連鎖隱性少汗癥 (HED) 是最常見的ED,主要由EDA基因突變引起。目前,已發(fā)現(xiàn)超過200種EDA基因突變。EDA蛋白是一種腫瘤壞死因子超家族成員,作為信號分子參與上皮形態(tài)發(fā)生。通過與其受體EDAR結(jié)合,EDA激活下游靶蛋白,調(diào)控相關(guān)細(xì)胞過程。EDAR與EDARADD基因突變會導(dǎo)致常染色體顯性或隱性遺傳的HED。除了牙齒發(fā)育受損外,ED還常伴隨輕微的外胚層異常。
Witkop綜合征是一種罕見的常染色體顯性ED,涉及牙齒和指甲異常,由MSX1基因突變引起。盡管少數(shù)病例中有毛發(fā)稀疏或細(xì)弱,大多數(shù)患者的毛發(fā)和汗腺正常。MSX1是一個轉(zhuǎn)錄因子,在脊椎動物發(fā)育過程中發(fā)揮關(guān)鍵作用,參與多個組織的發(fā)育。在小鼠中,MSX1對牙胚的初期發(fā)育至關(guān)重要,其缺失會導(dǎo)致牙齒發(fā)育停滯和顱面骨骼缺陷。超過20種MSX1突變與人類的綜合征性和非綜合征性TA相關(guān)。
牙甲皮發(fā)育不良 (OODD) 和Schopf–Schulz–Passarge綜合征 (SSPS) 由WNT10A基因的純合或復(fù)合雜合突變引起,是常染色體隱性遺傳病。這些病癥表現(xiàn)為干燥頭發(fā)、嚴(yán)重的TA、光滑舌、掌跖角化病和指甲異常。WNT10A在牙齒發(fā)育中扮演重要角色,通過Wnt-β-catenin信號通路激活下游靶基因。盡管在小鼠中WNT10A敲除導(dǎo)致牙齒發(fā)育異常,但人類的TA表型卻與之相反,表現(xiàn)為牙齒缺失。
在一些巴勒斯坦血緣家族中,KREMEN1基因的純合突變被與ED相關(guān)聯(lián)。KREMEN1作為Wnt信號通路的負(fù)調(diào)節(jié)因子,通過抑制Wnt信號的轉(zhuǎn)導(dǎo)調(diào)節(jié)細(xì)胞過程。KREMEN1突變的小鼠表現(xiàn)為肢體缺陷和骨密度增高,但未見顯著的其他表型。
2.1.2. 口面部裂隙綜合征
范德沃德綜合征 (VWS) 是最常見的唇腭裂綜合征之一,具有常染色體顯性遺傳方式。患者通常有唇裂(可能伴腭裂),并可能出現(xiàn)TA。VWS由IRF6基因突變引起,IRF6在顱面發(fā)育過程中調(diào)節(jié)角質(zhì)形成細(xì)胞的增殖和分化。小鼠模型顯示IRF6缺失會導(dǎo)致皮膚、肢體和顱面發(fā)育異常,表現(xiàn)為腭裂等畸形。IRF6的突變是孤立性和綜合征性唇腭裂的主要遺傳因素。
唇腭裂-外胚層發(fā)育不良綜合征是由PVRL1基因突變引起的一種罕見的常染色體隱性遺傳病。PVRL1編碼的nectin-1在細(xì)胞間粘附和緊密連接的形成中發(fā)揮關(guān)鍵作用。臨床上,患者可能表現(xiàn)為獨(dú)特的面部特征、唇腭裂、外胚層發(fā)育不良、手指或腳趾并指畸形及牙齒發(fā)育異常。
2.1.3. Axenfeld–Rieger綜合征
Axenfeld–Rieger綜合征是一種常染色體顯性遺傳病,表現(xiàn)為眼前節(jié)發(fā)育異常,約50%的患者因青光眼失明。此病還可能伴隨全身異常,如臍帶復(fù)舊不全、尿道下裂及牙齒異常。該病由PITX2基因突變引起,該基因在牙齒發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用。小鼠研究表明,PITX2缺失導(dǎo)致牙齒發(fā)育停止,并在脊椎動物的左右不對稱形成中扮演關(guān)鍵角色。
2.1.4. 家族性腺瘤性息肉病綜合征
家族性腺瘤性息肉病 (FAP) 是一種常染色體顯性遺傳病,特征為結(jié)腸和直腸的多發(fā)性腺瘤性息肉。該病還可能伴隨表皮樣囊腫、纖維瘤和牙齒異常,包括多生牙和復(fù)合牙瘤等。FAP由APC基因突變引起,約17%的患者有牙齒異常,部分病例出現(xiàn)TA。研究表明,F(xiàn)AP患者的牙齒異??赡芘c結(jié)腸癌的遺傳易感性相關(guān)。
2.1.5. 少牙-結(jié)直腸癌綜合征
AXIN2基因的種系突變與芬蘭一個家族的少牙癥和結(jié)直腸癌密切相關(guān)。該家族的成員有多達(dá)8顆恒牙缺失。研究還發(fā)現(xiàn)AXIN2突變與結(jié)直腸癌相關(guān)基因變異密切相關(guān),提示這些基因可能在牙齒發(fā)育及腫瘤發(fā)展中發(fā)揮作用。
2.2. 孤立性(非綜合征性)牙齒缺失
動物模型中綜合征性缺牙(TA)的綜合征形式和與正常牙齒發(fā)育有關(guān)的基因?yàn)樽R別人類孤立性綜合征性缺牙(TA)的候選基因提供了重要線索。迄今為止,已有許多基因被提出為孤立性綜合征性缺牙(TA)的病因(表 2)。
表 2.:與孤立性牙齒發(fā)育不全有關(guān)的基因。
2.2.1. MSX1
MSX1突變是孤立性綜合征性缺牙(TA)患者中首次描述的突變 [ 152 ]。此后,已報道了 20 多種與孤立性綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的MSX1突變,其中大多數(shù)是位于同源框結(jié)構(gòu)域的無義突變或錯義突變,這表明MSX1的單倍體不足是綜合征性缺牙(TA)表型的基礎(chǔ) [ 153 ](圖 1)。同源框結(jié)構(gòu)域的突變會破壞 DNA 結(jié)合并優(yōu)先導(dǎo)致孤立性 TA,同時蛋白質(zhì)天然未折疊的 N 端部分的變異通常會導(dǎo)致口面部裂。這些觀察結(jié)果表明,MSX1 突變的影響與受影響的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域直接相關(guān)。MSX1相關(guān)綜合征性缺牙(TA)通常包括缺失上頜和下頜第二前磨牙以及上頜第一前磨牙。
2.2.2. PAX9
PAX9 屬于成對盒 (PAX) 轉(zhuǎn)錄因子家族,這個家族對多種多細(xì)胞生物的正常發(fā)育至關(guān)重要。除了 MSX1 外,PAX9 長期被認(rèn)為與分離型綜合征性缺牙(TA)表型相關(guān),且是牙齒發(fā)育研究中最廣泛研究的基因之一 。PAX9 在假定的牙間充質(zhì)中表達(dá),起到激活信號并啟動牙齒發(fā)育的作用。在小鼠模型中,PAX9 的缺失會導(dǎo)致牙齒發(fā)育在芽期停止。
迄今為止,已收錄了30多種與綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的 PAX9 變異,其中大多數(shù)位于基因外顯子2,表現(xiàn)為插入/缺失或錯義突變,這些變異影響了 PAX9 蛋白的配對結(jié)構(gòu)域 (見圖1)。PAX9 變異通常與第二恒磨牙的發(fā)育不全有關(guān),其次是第二前磨牙,少數(shù)情況下也與前牙發(fā)育不全相關(guān)??傮w而言,TA 表型的嚴(yán)重程度與突變類型及其對 PAX9 功能的影響密切相關(guān)。與錯義突變的個體相比,攜帶無義突變或移碼突變的個體通常表現(xiàn)出更嚴(yán)重的表型。在綜合征性缺牙(TA)中,已知的 PAX9 突變呈雜合遺傳,符合常染色體顯性遺傳模式,表明單倍體不足可能是導(dǎo)致該表型的原因。有研究表明,攜帶 PAX9 突變的綜合征性缺牙(TA)患者通常表現(xiàn)出較小的牙冠尺寸。
2.2.3. AXIN2
AXIN2 的稀有和常見變異與孤立型綜合征性缺牙(TA)有關(guān),且常表現(xiàn)為受影響牙齒的混合發(fā)育模式。在綜合征性缺牙(TA)個體中,已描述了磨牙、下切牙和上側(cè)切牙的發(fā)育不全,并且至少有一顆切牙缺失的情況較為常見。文獻(xiàn)中廣泛報道了五種 AXIN2 突變,包括四種錯義突變(c.956+16A > G;p.Pro50Ser、c.2051C > T;p.Ala684Val、c.2062C > T;p.Leu688Leu 和 c.2272G > A;p.Ala758Thr)和一種移碼突變(c.1994insG;p.Asn666GlyfsX41)。在所有受影響的個體中,移碼突變與牙齒缺失的關(guān)聯(lián)性高于錯義突變。
2.2.4. WNT10A
WNT10A 一直是許多綜合征性缺牙(TA)遺傳研究的重點(diǎn)。在缺失1至3顆牙齒的綜合征性缺牙(TA)患者中,約 15.8% 的病例以及缺失超過4顆牙齒的綜合征性缺牙(TA)患者中,約 52% 的病例已發(fā)現(xiàn) WNT10A 的 50 多種雜合、純合及復(fù)合雜合變異 。最近的基因型-表型相關(guān)性研究為 WNT10A 在綜合征性缺牙(TA)中的作用提供了深入的見解。總體而言,與僅攜帶單一變異的個體相比,WNT10A 的復(fù)合雜合突變與嚴(yán)重的綜合征性缺牙(TA)和大量牙齒缺失相關(guān)。盡管 WNT10A 變異個體沒有特定的牙齒缺失模式,但上頜和下頜磨牙以及下頜前牙缺失的情況經(jīng)常被報。值得注意的是,雜合的 WNT10A 變異也已在未患綜合征性缺牙(TA)的家庭成員以及無綜合征性缺牙(TA)或無綜合征性缺牙(TA)家族史的對照個體中發(fā)現(xiàn)。據(jù)估計,攜帶 WNT10A 單一雜合變異的個體中,約 41% 不會患上 TA。
圖1 展示了在綜合征性缺牙(TA)患者中發(fā)現(xiàn)的 WNT10A 變異。一些 WNT10A 變異被認(rèn)為是特定人群中常見的“熱點(diǎn)”突變。例如,c.637G > A (p.Gly213Ser) 變異在亞洲人群中較為常見,而 c.682T > A (p.Phe228Ile) 變異則在白種人群體中的綜合征性缺牙(TA)患者中以純合或雜合形式廣泛報道,且在正常對照中也有 2.3% 的頻率。Phe228Ile 變異是最常見的變異,通常與 WNT10A 或其他基因中的變異共同出現(xiàn)。這些發(fā)現(xiàn)支持綜合征性缺牙(TA)的寡基因遺傳模型,后文將對此進(jìn)行討論。
2.2.5. LRP6
LRP6(LDL 受體相關(guān)蛋白 6)是 Wnt/β-catenin 信號通路中的輔助受體,最近有研究表明它在孤立型綜合征性缺牙(TA)的發(fā)病中起到一定作用。在患有散發(fā)性綜合征性缺牙(TA)或家族中有綜合征性缺牙(TA)分離現(xiàn)象的個體中,發(fā)現(xiàn)了六種 LRP6 變異,包括一個無義變異(c.1779dupT,p.Glu594*)、兩個插入突變(c.2224_2225dupTT,p.Leu742Phefs7 和 c.1144_1145dupAG,p.Ala383Glyfs8)以及一個剪接位點(diǎn)突變(c.3607+3_6del,p.?),這些突變均導(dǎo)致截短的 mRNA 產(chǎn)物,此外還有一個錯義突變(c.56C > T,p.Ala19Val)。在小鼠中,LRP6 在牙囊和內(nèi)釉質(zhì)上皮中表達(dá),而 LRP6 的純合缺失會導(dǎo)致嚴(yán)重的骨骼異常并且致死。
2.2.6. 近期與綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的其他基因
在 7 名患有 TA(牙齒發(fā)育不全)和其他畸形(如牛牙畸形、毛發(fā)稀疏且生長緩慢、皮膚干燥和瘙癢)的患者中發(fā)現(xiàn)了 GREM2(編碼 GREMLIN2)的突變 。GREMLIN2 被知曉在胚胎發(fā)育過程中調(diào)節(jié) BMP,其中 BMP4 在牙齒發(fā)育中起著重要作用,且其敲除會導(dǎo)致小鼠牙齒發(fā)育停滯。有趣的是,盡管 GREM2 基因敲除小鼠的牙齒小且畸形,但牙齒發(fā)育并未停滯。這些發(fā)現(xiàn)表明 GREM2 在牙齒發(fā)育過程中可能發(fā)揮著作用。GREM2 中的三種錯義突變(p.Ala13Val、p.Glu136Asp 和 p.Gln76Glu)已被鑒定為與單獨(dú)患綜合征性缺牙(TA)的個體相關(guān)的致病變異,且尚未與其他結(jié)構(gòu)畸形相關(guān)。即便在同一家族中,GREM2 突變的表現(xiàn)度也有所不同。
EDA、EDAR 和 EDARADD 也被認(rèn)為與孤立型綜合征性缺牙(TA)相關(guān)。在一項(xiàng)基因型-表型相關(guān)性研究中,孤立型綜合征性缺牙(TA)患者中的所有 EDA 突變均為錯義突變,并且最可能出現(xiàn)在 TNF 結(jié)構(gòu)域。
另一個與 WNT 通路相關(guān)的基因 WNT10B(無翅型 MMTV 整合位點(diǎn)家族,成員 10B)也與孤立型綜合征性缺牙(TA)相關(guān),盡管這種變異主要出現(xiàn)在中國和泰國的家族中。在中國的綜合征性缺牙(TA)患者中,尤其是缺失上側(cè)門牙的個體中,發(fā)現(xiàn)了 WNT10B 中的三個雜合錯義突變(c.632G > A,p.Arg211Gln;c.569C > G,p.Pro190Arg;和 c.851T > G,p.Phe284Cys)以及一個無義突變(c.786G > A,p.Trp262*)。最近在泰國的五個家族中,發(fā)現(xiàn)了兩個雜合錯義突變(c.475G > C,p.Ala159Pro 和 c.1052G > A,p.Arg351His),并與單獨(dú)的綜合征性缺牙(TA)以及小牙畸形和牛牙畸形等其他牙齒異常相關(guān)。
ANTXR1(炭疽毒素受體1)的純合錯義變異 c.1312C > T(p.Arg438Cys)已被證實(shí)與土耳其一家庭的 TA(少牙癥)相關(guān)。ANTXR1 的純合和雙等位基因突變與生長遲緩、脫發(fā)、假無牙癥和視神經(jīng)萎縮(GAPO)綜合征相關(guān),這些癥狀屬于常染色體隱性遺傳特征。在小鼠中,有針對性地破壞 Antxr1 可獲得無重大結(jié)構(gòu)缺陷的存活小鼠,但觀察到牙齒過度生長、門牙錯位和牙齒發(fā)育不良。在牙齒發(fā)育的早期階段,Antxr1 的表達(dá)存在于發(fā)育中的舌、上頜和下頜突的上皮、牙齒上皮及間充質(zhì)中,后期則出現(xiàn)在釉質(zhì)器上皮和牙乳頭中,并最終轉(zhuǎn)移至成釉細(xì)胞的極化層和正在分化的成牙本質(zhì)細(xì)胞中。ANTXR1 是一種與結(jié)直腸癌相關(guān)的腫瘤特異性內(nèi)皮細(xì)胞標(biāo)志物,在腫瘤血管生成過程中上調(diào)。此前,Lammi 等人 發(fā)現(xiàn)腫瘤抑制基因 AXIN2 的突變與一例患有嚴(yán)重 TA(少牙癥)和結(jié)直腸癌的家族相關(guān),并提出綜合征性缺牙(TA)和結(jié)直腸癌可能具有共同的遺傳病因。此后,已有大量研究報道與綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的癌癥基因變異。這些發(fā)現(xiàn)凸顯了綜合征性缺牙(TA)的復(fù)雜性,并強(qiáng)調(diào)在研究中考慮修飾基因和/或基因間相互作用的必要性。
最近的一項(xiàng)全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)納入了 1900 多例綜合征性缺牙(TA)病例和 33 萬例具有歐洲血統(tǒng)的對照,發(fā)現(xiàn)了 4 種與綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的新風(fēng)險變異,以及 5 種與綜合征性缺牙(TA)伴隨口面部腭裂的綜合表型相關(guān)的風(fēng)險變異 ??谇划惓J强诿娌侩窳褍和某R姲Y狀,人們根據(jù)相關(guān)口腔異常的模式提出了腭裂亞表型。在這9個變異中,5個位于或接近與牙齒發(fā)育和/或其他外胚層結(jié)構(gòu)發(fā)育有關(guān)的 Wnt 通路基因(EDA、EDAR、FOXI3、FORXP1 和 LEF1),其余 4 個則位于或接近與綜合征性缺牙(TA)或牙齒發(fā)育無關(guān)的基因(ASCL5/CACNA1S、ARHGAP15、NOL11 和 FAM49A)。此外,本研究還發(fā)現(xiàn) WNT10A 中的兩個已知變異(p.Phe228Ile 和 p.Cys107*)與綜合征性缺牙(TA)顯著相關(guān)。
3. 單基因遺傳模型與寡基因遺傳模型
近年來,針對多種孟德爾疾病,研究者提出了寡基因遺傳和多位點(diǎn)變異模型,并進(jìn)一步確立了突變負(fù)荷的概念。對于TA(少牙癥),寡基因遺傳的證據(jù)逐漸顯現(xiàn),這得到了最近全外顯子組測序研究和對多個候選基因進(jìn)行直接測序研究結(jié)果的支持。
研究表明,MSX1和PAX9的雙基因突變與更嚴(yán)重的TA表型(15至17顆牙齒缺失)相關(guān)。這些基因之間的相互作用已經(jīng)初步揭示:PAX9與MSX1共同作用,協(xié)同激活下游牙齒發(fā)育基因(如BMP4)的表達(dá),這對于牙齒形態(tài)發(fā)生至關(guān)重要。當(dāng)這兩個基因發(fā)生雙基因突變時,它們的相互作用可能會被破壞,從而導(dǎo)致更嚴(yán)重的TA表型。
最近的研究還發(fā)現(xiàn),TA患者中有些人表現(xiàn)出WNT10A的雙等位基因或雜合基因型,并同時攜帶EDA、EDAR或EDARADD基因的純合或雜合突變,這表明不同基因中等位基因的綜合效應(yīng)導(dǎo)致了TA。此外,在一名上頜恒尖牙TA患者中,發(fā)現(xiàn)了WNT10A的復(fù)合雜合突變(IVS2 + 1G > A和c.637G > A)以及GREM2的錯義雜合變體(c.38C > T)。
在一個土耳其近親家族中,還發(fā)現(xiàn)了DKK1(Dickkopf WNT信號通路抑制因子1;c.548-4G > T)和COL17A1(XVII型膠原蛋白α1鏈;c.3277 + 3G > C)中的雜合剪接突變,以及LAMA3(層粘連蛋白α3亞基;c.2798G > T)中的雜合錯義變體與TA相關(guān)。這些基因的致病突變尚未在TA患者中廣泛發(fā)現(xiàn),但由于它們的生物學(xué)作用和/或與疾病表型的相關(guān)性,它們可以被視為潛在的候選基因。DKK1編碼高親和力的Dickkopf同源物1跨膜受體,能夠與LRP6協(xié)同作用,在發(fā)育及其他細(xì)胞過程中阻斷Wnt信號傳導(dǎo)。在小鼠中,DKK1在牙齒間充質(zhì)、成牙本質(zhì)細(xì)胞和成骨細(xì)胞中表達(dá),其轉(zhuǎn)基因小鼠胚胎口腔上皮中的異位表達(dá)會阻斷上皮和間充質(zhì)的信號傳導(dǎo),導(dǎo)致牙齒發(fā)育在芽期停止。此外,DKK1的常見單核苷酸多態(tài)性(rs11001553)已被發(fā)現(xiàn)在中國漢族人群中與單獨(dú)的TA相關(guān)。
LAMA3基因突變與交界性大皰性表皮松解癥(OMIM #226650)相關(guān),這是一種常染色體隱性皮膚病,特征包括多發(fā)水皰、糜爛、營養(yǎng)不良性指甲、牙釉質(zhì)發(fā)育不全和牙齒發(fā)育不全。在小鼠中,LAMA3的靶向破壞會導(dǎo)致成釉質(zhì)細(xì)胞分化缺陷。在患有牙釉質(zhì)缺陷的大皰性表皮松解癥患者中,也發(fā)現(xiàn)了COL17A1的突變。
此外,在一對意大利兄妹中,發(fā)現(xiàn)了PITX2基因5'UTR中的純合變異(c.-387delC > G),該變異與Axenfeld–Rieger綜合征相關(guān),以及BMP4中的純合錯義變異(c.T455C,p.Val152Ala),這些變異與單獨(dú)的TA一起分離。
多個基因座中的潛在致病等位基因的發(fā)現(xiàn)表明,孤立型TA可能存在寡基因遺傳和多位點(diǎn)變異模型,這可能導(dǎo)致表型的多樣性。隨著對特征明確的TA個體和家族進(jìn)行全基因組測序,并仔細(xì)研究基因型-表型相關(guān)性,可能會發(fā)現(xiàn)新的TA相關(guān)基因,這些基因可能單獨(dú)作用或與其他基因相互作用。
4. 遺傳途徑是未來研究的重點(diǎn)
多年來,使用轉(zhuǎn)基因動物的研究表明,BMP、FGF 和 WNT 信號通路基因缺陷會導(dǎo)致嚴(yán)重的牙齒發(fā)育異常,范圍從牙齒形態(tài)缺陷到牙齒發(fā)育完全停止 。同時,尚未發(fā)現(xiàn)與綜合征性缺牙(TA)相關(guān)的 FGF 家族基因突變,而在一個綜合征性缺牙(TA)家族中發(fā)現(xiàn)了BMP4的單一變體(見上文)。
目前的現(xiàn)有證據(jù)支持 WNT 通路基因在孤立性綜合征性缺牙(TA)中發(fā)揮重要作用,最主要的是TA 個體中AXIN2、WNT10A、WNT10B和LRP6的致病突變頻率較高。WNT 信號分子對于胚胎發(fā)育過程中多種細(xì)胞類型的模式化、增殖和分化至關(guān)重要。據(jù)報道,牙上皮分泌 WNT,特別是WNT4、WNT6和WNT10,對牙齒發(fā)育至關(guān)重要,因?yàn)?WNT 信號的缺失會導(dǎo)致釉質(zhì)結(jié)功能障礙,隨后導(dǎo)致牙齒發(fā)育停滯。
EDA、EDAR和EDARADD在綜合征型和孤立型綜合征性缺牙(TA)中均發(fā)揮作用,它們屬于 NF-kB 信號通路。NF-kB 通路中的其他基因包括NEMO(核因子 κB 激酶亞基 γ 抑制劑,一種重要的通路調(diào)節(jié)劑)和TRAF6(TNF 受體相關(guān)因子 6),盡管人們對這些基因在牙齒發(fā)育中的確切作用知之甚少,并且據(jù)報道,在綜合征型綜合征性缺牙(TA)患者中這兩個基因存在變異 。
基于上述觀察,多位點(diǎn)變異是某些綜合征性缺牙(TA)病例的潛在解釋,候選基因?qū)儆谙嗤虿煌男盘柾?,可以假設(shè)單獨(dú)的綜合征性缺牙(TA)可能是多個基因變異的結(jié)果,這些基因單獨(dú)作用或與其他基因結(jié)合作用,導(dǎo)致該疾病的不同表現(xiàn)度。確定綜合征性缺牙(TA)中假定缺陷基因的全部范圍、它們所屬的通路(圖 2)、它們的功能和相互作用伙伴,將有助于我們更好地了解綜合征性缺牙(TA)的潛在機(jī)制,并可能成為未來預(yù)防和牙齒替換策略的基礎(chǔ)。
5. 結(jié)論
孤立性綜合征性缺牙(TA)是一種異質(zhì)性疾病,其表現(xiàn)形式各異。雖然許多基因的變異被認(rèn)為是綜合征性缺牙(TA)的病因,但許多個體的綜合征性缺牙(TA)病因仍未解決,可能反映了牙齒發(fā)育中未知的基因突變或多位點(diǎn)變異的存在。此外,環(huán)境和表觀遺傳因素也可能被視為綜合征性缺牙(TA)表型的可能因素,應(yīng)在未來的研究中加以探索。對特征明確的個體和家族進(jìn)行下一代測序研究具有獨(dú)特的能力,可以識別整個基因組中所有綜合征性缺牙(TA)易感變異,同時揭示可能對牙齒發(fā)育至關(guān)重要的重要遺傳和網(wǎng)絡(luò)相互作用。進(jìn)一步的遺傳和功能研究側(cè)重于新發(fā)現(xiàn)的基因和途徑,有可能闡明孤立性綜合征性缺牙(TA)的遺傳圖景,并為預(yù)防和治療策略提供見解。針對綜合征性缺牙(TA)相關(guān)基因和/或途徑的靶向療法可能代表未來的牙齒替代療法。