【佳學(xué)基因檢測】CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性
腫瘤基因檢測與靶向藥物選擇導(dǎo)讀:
背景:
隨著對乳腺癌遺傳性的重視,尋找乳腺癌遺傳易感基因成為熱點(diǎn)。目前已有多項(xiàng)研究探討了分化簇44(CD44)基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系,但研究結(jié)論并不一致。因此,乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將利用這項(xiàng)薈萃分析來探索這種基因多態(tài)性在乳腺癌易感性中的作用。
方法:
本研究檢索時間自2021年3月建庫起設(shè)定。檢索數(shù)據(jù)庫包括中國知網(wǎng)、萬方、VIP信息中文期刊服務(wù)平臺、中國生物醫(yī)學(xué)光盤、PubMed、EMBASE、Web of Science和Cochrane圖書館。對象為CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌關(guān)系的觀察性研究(包括病例對照研究、橫斷面研究和隊(duì)列研究)。語言僅限于英文和中文。提取納入研究的數(shù)據(jù),由兩名研究人員獨(dú)立評價(jià)文獻(xiàn)質(zhì)量。數(shù)據(jù)通過Stata 16.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。
結(jié)果:
本研究將在已有研究的基礎(chǔ)上,系統(tǒng)評價(jià)CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系。
結(jié)論:
本研究將為闡明CD44基因多態(tài)性在乳腺癌中的作用提供循證醫(yī)學(xué)證據(jù),為乳腺癌的早期發(fā)現(xiàn)和預(yù)防干預(yù)提供幫助。
道德與傳播:
不會公開來自個人的私人信息。該系統(tǒng)評價(jià)也不涉及危害參與者的權(quán)利。不需要道德批準(zhǔn)。結(jié)果可能會發(fā)表在同行評審的期刊上或在相關(guān)會議上傳播。
OSF 注冊號:
DOI 10.17605/OSF.IO/WBC7F
關(guān)鍵詞: 乳腺癌,分化簇44,基因多態(tài)性,薈萃分析,方案
1. 基因檢測與靶向藥物基礎(chǔ)知識:
乳腺癌是女性常見的惡性腫瘤。根據(jù)世界衛(wèi)生組織2018年公布的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù),乳腺癌是世界上先進(jìn)個威脅女性健康的惡性腫瘤。世界上乳腺癌的新病例超過200萬。2018年女性乳腺癌發(fā)病率和死亡率分別為46.3/105和13.0/105,且呈上升趨勢。每年,中國乳腺癌新發(fā)病例數(shù)和死亡人數(shù)分別約占世界乳腺癌死亡人數(shù)的12.2%和9.6%。由于延誤診斷,晚期乳腺癌患者的數(shù)量有所增加。以往的研究表明,乳腺癌的早期診斷可以顯著提高患者的生存率,但目前臨床上缺乏早期篩查的有效手段。研究證實(shí),乳腺癌具有遺傳易感性。探索基因與乳腺癌的關(guān)系,有助于乳腺癌的早期診斷和預(yù)防。
分化簇 44 (CD44) 是一種多結(jié)構(gòu)和多功能的跨膜糖蛋白,可用作透明質(zhì)酸和許多其他細(xì)胞外基質(zhì)成分以及多種生長因子和細(xì)胞因子的受體。許多研究表明,CD44參與了細(xì)胞的許多關(guān)鍵過程,包括細(xì)胞的生長、繁殖、分化、粘附和遷移。[ 6、7 ] _ _CD44也是一種常見的腫瘤標(biāo)志物,與腫瘤細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲密切相關(guān),參與腫瘤相關(guān)的血管生成。研究發(fā)現(xiàn),CD44在多種癌細(xì)胞中廣泛表達(dá),影響疾病的預(yù)后,而CD44的特異性敲低會抑制癌癥的發(fā)生和發(fā)展。
CD44基因rs13347位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌的相關(guān)性已被眾多學(xué)者關(guān)注。雖然關(guān)于CD44基因rs13347位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌易感性關(guān)系的研究較多,但結(jié)論仍存在爭議。一些研究發(fā)現(xiàn)CD44基因rs13347位點(diǎn)的多態(tài)性增加了患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn),而一些研究得出了相反的結(jié)論,即CD44基因的rs13347位點(diǎn)的多態(tài)性降低了患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)。癌癥。為了探究這種差異的來源(如是否與種族、民族、地區(qū)人群或研究方法的差異等有關(guān)),并闡明CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系,乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將采用采用薈萃分析的方法對現(xiàn)有數(shù)據(jù)進(jìn)行綜合分析,以期為CD44基因rs13347位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌遺傳易感性的關(guān)系提供循證醫(yī)學(xué)證據(jù)。
2.方法
2.1。協(xié)議寄存器
本系統(tǒng)評價(jià)和薈萃分析方案是在系統(tǒng)評價(jià)和薈萃分析方案的先進(jìn)報(bào)告項(xiàng)目的指導(dǎo)下起草的。此外,它已在開放科學(xué)框架(OSF)上注冊(注冊號:DOI 10.17605/OSF.IO/WBC7F)。
2.2. 倫理
由于該計(jì)劃不需要招募患者和收集個人信息,因此不需要倫理委員會的批準(zhǔn)。
2.3. 資格標(biāo)準(zhǔn)
- (1)
- 受試者為病理診斷為乳腺癌者和對照組(非乳腺癌患者)。對患者的年齡、種族和地區(qū)沒有任何限制。
- (2)
- 研究類型為觀察性研究,研究CD44基因rs13347位點(diǎn)多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系(包括病例對照研究、橫斷面研究、隊(duì)列研究)。語言僅限于中文和英文。
- (3)
- 等位基因或基因型的分布頻率數(shù)據(jù)可用。
- (4)
- 基因型的分布頻率符合哈代-溫伯格定律。
2.4. 排除標(biāo)準(zhǔn)。
- (1)
- 多次發(fā)表研究。
- (2)
- 發(fā)表的文獻(xiàn)為摘要或綜述的文章,文章數(shù)據(jù)不完整或不正確,聯(lián)系作者后無法獲得完整數(shù)據(jù)。
- (3)
- 關(guān)于未能提供有關(guān)基因型頻率的詳細(xì)數(shù)據(jù)的研究。
- (4)
- 動物研究或?qū)嶒?yàn)研究。
2.5. 檢索策略
以“CD44”、“基因多態(tài)性”、“乳腺癌”為中文檢索詞,在中國知識基礎(chǔ)設(shè)施、萬方、VIP信息中文期刊服務(wù)平臺、中國生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)庫等中文數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行檢索。“Cluster of Differentiation 44”、“CD44”、“polymorphism”、“breast cancer”、“breast cancer”等在PubMed、EMBASE、Web of Science和Cochrane等英文數(shù)據(jù)庫中被用作英文檢索詞圖書館。自2021年3月建庫以來,收集了所有關(guān)于CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌關(guān)系的文獻(xiàn)。以 PubMed 為例,檢索策略見表???
表格1
1.
表格1
PubMed 數(shù)據(jù)庫中的搜索策略。
數(shù)字
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搜索詞
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#1
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分化集群 44 [標(biāo)題/摘要]
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#2
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CD44 [標(biāo)題/摘要]
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#3
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rs13347 [標(biāo)題/摘要]
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#4
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#1 或 #2 或 #3
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#5
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多態(tài)性 [標(biāo)題/摘要]
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#6
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基因突變序列 [標(biāo)題/摘要]
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#7
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#5 或 #6
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#8
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乳腺癌 [MeSH]
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#9
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乳腺腫瘤 [標(biāo)題/摘要]
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#10
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乳腺腫瘤 [標(biāo)題/摘要]
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#11
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乳腺癌 [標(biāo)題/摘要]
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#12
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乳腺惡性腫瘤 [標(biāo)題/摘要]
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#13
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乳腺惡性腫瘤 [標(biāo)題/摘要]
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#14
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乳腺癌 [標(biāo)題/摘要]
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#15
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人類乳腺癌 [標(biāo)題/摘要]
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#16
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人類乳腺腫瘤 [標(biāo)題/摘要]
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#17
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乳腺癌 [標(biāo)題/摘要]
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#18
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#8 或 #9 或 #10 或 #11 或 #12 或 #13 或 #14 或 #15 或 #16 或 #17
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#19
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#4 和 #7 和 #18
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2.6. 數(shù)據(jù)篩選和提取
兩名研究者獨(dú)立完成文獻(xiàn)篩選,排除明顯不符合納入標(biāo)準(zhǔn)的研究,進(jìn)一步閱讀摘要和全文,判斷是否符合納入標(biāo)準(zhǔn)。文獻(xiàn)中包含的數(shù)據(jù)被提取和交叉檢查。如有分歧,請與第三位研究人員協(xié)商并達(dá)成共識。提取的數(shù)據(jù)包括:先進(jìn)作者、發(fā)表年限、發(fā)表國家、研究人群的種族、研究人群的基本特征(包括年齡、性別、疾病等)、研究人群分布每個基因的表型(是否遵循哈代-溫伯格平衡定律)、基因多態(tài)性的檢測方法等。文獻(xiàn)篩選流程如圖???
圖1
1.
圖1
流程圖。
2.7. 文獻(xiàn)質(zhì)量評估
病例對照研究和隊(duì)列研究采用紐卡斯?fàn)?渥太華量表 ,包括3欄8項(xiàng),共9分,評價(jià)標(biāo)準(zhǔn)≥6為高質(zhì)量,橫斷面研究為使用醫(yī)療保健研究和質(zhì)量局推薦的 11 項(xiàng)標(biāo)準(zhǔn)項(xiàng)目進(jìn)行評估,用于評估橫斷面研究。0 到 3 為低質(zhì)量,4到7 為中等質(zhì)量,8 到 11 為高質(zhì)量。
2.8. 統(tǒng)計(jì)分析
2.8.1. 數(shù)據(jù)分析處理 在評價(jià)基因多態(tài)性與乳腺癌的相關(guān)性之前,先用x 2檢驗(yàn)檢驗(yàn)各研究中對照組的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg遺傳平衡(P≥0.05)。采用STATA.16軟件進(jìn)行Meta分析,連續(xù)變量以標(biāo)準(zhǔn)均值差和95%置信區(qū)間表示,二元分類變量以比值比和95%置信區(qū)間表示。異質(zhì)性通過Q檢驗(yàn)和I 2進(jìn)行分析,異質(zhì)性根據(jù)I 2進(jìn)行評價(jià)。如果P ?> ?.1 ,我2 ?< ?50%,納入研究間異質(zhì)性小,采用固定效應(yīng)模型進(jìn)行分析;若P ?< ?.1 , I 2 ≥ 50%,則納入研究間異質(zhì)性明顯,分析異質(zhì)性來源。隨機(jī)效應(yīng)模型用于分析。
2.8.2. 處理缺失數(shù)據(jù) 如果所需研究的數(shù)據(jù)不完整或未在研究中報(bào)告,研究人員將通過電話或電子郵件聯(lián)系該研究的先進(jìn)作者或其他作者。如果所需數(shù)據(jù)不可用,乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將使用描述性分析而不是薈萃分析,并在必要時排除這些研究。
2.8.3. 亞組分析 為應(yīng)對不同研究之間的異質(zhì)性,將根據(jù)人群(如年齡、更年期等)、種族(黃種人、高加索人等)和地區(qū)(歐洲人、亞洲人等)進(jìn)行亞組分析。 .
2.8.4。敏感性分析 為了檢驗(yàn)meta分析結(jié)果的穩(wěn)定性,乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將通過Stata 16.0采用一一排除法分析結(jié)果的敏感性。
2.8.5。評估報(bào)告偏差 乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將使用漏斗圖來定性識別發(fā)表偏倚,并使用 Egger 和 Begg 檢驗(yàn)來定量評估發(fā)表偏倚。如果漏斗圖不對稱且P ?< . 05,認(rèn)為有明顯發(fā)表偏倚。
2.8.6。證據(jù)質(zhì)量評估 乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將使用推薦評估、開發(fā)和評估評分的分級方法對證據(jù)的結(jié)果指標(biāo)進(jìn)行分級。所有證據(jù)的質(zhì)量將根據(jù)五個方面(偏倚風(fēng)險(xiǎn)、間接性、不一致、不正確、發(fā)表偏倚)在四個級別(高、中、低或非常低)進(jìn)行評估。
3. 討論
乳腺癌的發(fā)病率在世界范圍內(nèi)逐漸增加。據(jù)世界衛(wèi)生組織估計(jì),到2025年,全球乳腺癌確診病例將超過1900萬例。乳腺癌發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,遺傳易感因素與乳腺癌發(fā)病機(jī)制密切相關(guān)。近年來,對乳腺癌易感基因的研究和探討成為世界各國學(xué)者關(guān)注的焦點(diǎn)。
目前,關(guān)于單核苷酸多態(tài)性與乳腺癌易感性關(guān)系的研究較多。然而,這些SNP基因,包括BRCA1和BRCA2,只能解釋大約25%的乳腺癌易感性和發(fā)病率。以往的研究表明,CD44 基因 SNP,可在 84% 的乳腺癌患者中檢測到。因此,CD44基因可能是影響乳腺癌易感性的高外顯率基因之一。人類CD44基因位于11號染色體的短臂(11p13),由20個高度保守的外顯子和不同長度的內(nèi)含子組成。越來越多的研究集中在CD44基因單核苷酸多態(tài)性對癌癥風(fēng)險(xiǎn)的影響上。其中以位于CD44基因3'-非翻譯區(qū)的rs13347多態(tài)性研究賊多。通過影響hsa-miR-509-3P對CD44基因的調(diào)控,影響CD44基因的表達(dá),進(jìn)而影響乳腺癌的發(fā)生發(fā)展。
由于基因多態(tài)性分析方法、種族和地區(qū)的不同,CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系存在爭議。因此,本研究將通過系統(tǒng)評價(jià)和薈萃分析探討CD44基因rs13347多態(tài)性與乳腺癌的關(guān)系,為CD44基因多態(tài)性在乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)評估、早期發(fā)現(xiàn)和預(yù)防中提供循證依據(jù)。
但是,本研究存在一些局限性:由于語言檢索的局限性,乳腺癌風(fēng)險(xiǎn)基因檢測的人工智能優(yōu)化課題組將僅將中文和英文文獻(xiàn)納入本研究,可能會忽略其他語言的研究。不同的種族、膚色和疾病等因素可能造成一定程度的臨床異質(zhì)性。
Shao Z, Wang Z, Shao L, Jin X.
Medicine (Baltimore). 2021 Jun 4;100(22):e25889. doi: 10.1097/MD.0000000000025889.
(責(zé)任編輯:佳學(xué)基因)