【佳學(xué)基因檢測(cè)】腦干神經(jīng)瘤NF2基因檢測(cè)結(jié)果陰性是怎么找到致病基因突變的？ 

神經(jīng)鞘瘤的基因檢測(cè)及靶向藥物治療概述

NF2 的雙等位基因失活代表了絕大多數(shù)神經(jīng)鞘瘤的主要或少有致癌驅(qū)動(dòng)基因突變。佳學(xué)基因神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)報(bào)告了一名 4 歲的女性患者，她接受了右側(cè)髓質(zhì)實(shí)質(zhì)內(nèi)神經(jīng)鞘瘤的次全切除術(shù)。RNA 測(cè)序發(fā)現(xiàn)存在YAP1的外顯子 5 和MAML2的外顯子 2之間的翻譯框內(nèi)融合。YAP1-MAML2融合以前曾在多種腫瘤類型中發(fā)現(xiàn)過，但在神經(jīng)鞘瘤中沒有記錄。神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)的報(bào)告擴(kuò)大了致癌 YAP1 基因融合的范圍，成為 NF2 失活以外的致病基因突變，包括散發(fā)性神經(jīng)鞘瘤，類似于賊近在 NF2 野生型兒科腦膜瘤中描述的情況。考慮到潛在的腫瘤易感綜合征的高患病率，所有孤立性神經(jīng)鞘瘤和腦膜瘤的年輕患者都應(yīng)進(jìn)行適當(dāng)?shù)捏w細(xì)胞和生殖系基因檢測(cè)檢測(cè)。在這些患者中，通過致病基因鑒定基因解碼發(fā)現(xiàn)一種體細(xì)胞非 NF2 致病基因突變，例如這種新描述的 YAP1 融合，可以幫助確定散發(fā)性神經(jīng)鞘瘤的診斷。

神經(jīng)鞘瘤的基因檢測(cè)及靶向藥物治療關(guān)鍵詞：

 神經(jīng)鞘瘤,兒科,Mastermind,轉(zhuǎn)錄輔激活因子,MAML2,Yes1,轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,YAP1

神經(jīng)鞘瘤的基因檢測(cè)及靶向藥物治療基本知識(shí)

神經(jīng)鞘瘤是偶發(fā)性或在遺傳性腫瘤易感性的背景下出現(xiàn)的良性周圍神經(jīng)鞘瘤；即2型神經(jīng)纖維瘤?。∟F2）或神經(jīng)鞘瘤病。NF2的雙等位基因失活是絕大多數(shù)神經(jīng)鞘瘤的主要或少有致癌驅(qū)動(dòng)基因突變；此外，SH3PXD2A-HTRA1融合也被基因解碼被確定為散發(fā)性神經(jīng)鞘瘤亞型的替代致癌驅(qū)動(dòng)因素。在新診斷的孤立性神經(jīng)鞘瘤的兒科和年輕成人患者中，高達(dá) 30% 的人賊終將被診斷為遺傳性腫瘤易感綜合征，即 NF2 或較少見的神經(jīng)鞘瘤病。然而，鑒于與假陰性種系檢測(cè)結(jié)果相關(guān)的鑲嵌現(xiàn)象的高流行率，正確確定種系狀態(tài)可能很困難 。

病例案例介紹

一名 4 歲女性接受了右側(cè)髓質(zhì)神經(jīng)鞘瘤的次全切除術(shù)。在進(jìn)行性頭部?jī)A斜的磁共振成像 (MRI) 上發(fā)現(xiàn)了腫瘤（圖 1）。既往病史因發(fā)育遲緩和面部不對(duì)稱（半面小兒）而顯著。在 18 個(gè)月大時(shí)進(jìn)行的先前 MRI 顯示小腦發(fā)育不全，但沒有腫瘤。在佳學(xué)基因進(jìn)行致病基因鑒定基因解碼前，采用的包括生殖系靶向基因檢測(cè)包基因檢測(cè)和全外顯子組測(cè)序在內(nèi)的綜合臨床基因檢查結(jié)果為陰性。診斷后 8 個(gè)月的賊近一次腦部 MRI 隨訪顯示穩(wěn)定的殘留病灶。

圖1：T1 加權(quán)增強(qiáng)后（左圖）和 T2/FLAIR 加權(quán)（右圖）磁共振圖像顯示部分增強(qiáng)的實(shí)質(zhì)內(nèi)右側(cè)髓質(zhì)腫瘤（箭頭）。腫瘤累及下腦橋右側(cè)、腦橋臂和小腦腹側(cè)

組織學(xué)檢查顯示腫瘤由緊密、交錯(cuò)的束狀單形梭形細(xì)胞組成（圖2a)，沒有維羅凱氏體或 Antoni B 區(qū)域。缺乏有絲分裂活動(dòng)，腫瘤細(xì)胞沿血管局部解剖成相鄰的神經(jīng)實(shí)質(zhì)。免疫組化研究表明，該病灶富含膠原蛋白 IV，腫瘤細(xì)胞 GFAP、EMA 和 SSTR2A 呈陰性，同時(shí)表達(dá) S100 蛋白（細(xì)胞質(zhì)/核）和 SOX10（細(xì)胞核）。

圖 2：腫瘤的蘇木精和伊紅染色 ( a ) 和 YAP1 的免疫組織化學(xué) ( b )

使用 Heidelberg 腦腫瘤分類 11b6版本進(jìn)行的DNA 甲基化分析顯示與甲基化類神經(jīng)鞘瘤匹配，校準(zhǔn)分?jǐn)?shù)為 0.97。腫瘤和匹配的正常樣本的配對(duì)靶向二代測(cè)序分析結(jié)果表明體細(xì)胞突變和結(jié)構(gòu)變異均呈陰性，并揭示了相對(duì)平坦的 DNA 拷貝數(shù)譜，在包括YAP1基因座在內(nèi)的 11q 染色體上具有焦點(diǎn)基因組增加和丟失（如圖 3) 。使用錨定多重 PCR 的 RNA 測(cè)序揭示了YAP1的外顯子 5 和MAML2的外顯子 2之間的存在閱讀框內(nèi)融合（圖  4）。在 NF2-野生型腦膜瘤 和其他癌癥中記錄了YAP1-MAML2融合，但在神經(jīng)鞘瘤中在現(xiàn)有所有數(shù)據(jù)庫中沒有記錄。正如迄今為止記錄的所有 N 端 YAP1 融合中所見，在神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)的患者中檢測(cè)到的融合保留了 YAP1 的 TEAD 轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合域，以及 MAML2 的核定位序列和反式激活域。由此產(chǎn)生的融合蛋白通過組成性核定位和對(duì)蛋白酶體降解的抗性對(duì) Hippo 腫瘤抑制途徑的抑制性信號(hào)傳導(dǎo)具有抗性 。與這些觀察結(jié)果一致，神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)通過免疫組織化學(xué)證實(shí)了 YAP1 的強(qiáng)核定位，以及神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)患者腫瘤中較弱的細(xì)胞質(zhì)標(biāo)記（圖 2B）。

3：來自腫瘤和匹配正常樣本的配對(duì)靶向下一代測(cè)序分析的 DNA 拷貝數(shù)譜，揭示了相對(duì)平坦的 DNA 拷貝數(shù)譜，在包括 YAP1 在內(nèi)的 11q 號(hào)染色體上具有焦點(diǎn)基因組增益（以紅色表示）和缺失（以藍(lán)色表示）軌跡。CNA：拷貝數(shù)改變

圖 4：使用錨定多重 PCR 的 RNA 測(cè)序揭示了 YAP1 的外顯子 5 和 MAML2 的外顯子 2 之間的框內(nèi)融合

神經(jīng)鞘瘤的致病基因突變及其正確診斷的分析及共識(shí)

神經(jīng)外科腫瘤的基因解碼與基因檢測(cè)在 NF2 野生型神經(jīng)鞘瘤中發(fā)現(xiàn)的致癌YAP1-MAML2融合支持這樣的觀點(diǎn)，即通過效應(yīng)器 YAP/TAZ 的典型 Hippo 信號(hào)傳導(dǎo)是神經(jīng)鞘瘤發(fā)生所必需的 。包括腦干神經(jīng)鞘瘤在內(nèi)的實(shí)質(zhì)內(nèi)神經(jīng)鞘瘤是罕見的，并且在分子上沒有很好的特征 。

在患有孤立性神經(jīng)鞘瘤或腦膜瘤的兒科和年輕成人患者中，分別高達(dá) 30% 和 50% 將具有可識(shí)別的遺傳易感性，賊常見的是 NF2 。因此，建議對(duì)所有孤立性神經(jīng)鞘瘤或腦膜瘤的年輕患者進(jìn)行適當(dāng)?shù)呐R床篩查檢查和腫瘤和生殖系的分子遺傳學(xué)檢測(cè)。然而，由于嵌合體的高患病率，在生殖系檢測(cè)陰性的患者中很難排除 NF2 或神經(jīng)鞘瘤病的診斷 。在此類患者中，識(shí)別出體細(xì)胞非 NF2 驅(qū)動(dòng)改變，例如YAP1融合，可以幫助確定散發(fā)性神經(jīng)鞘瘤或腦膜瘤的診斷信心，并且可能不需要進(jìn)一步的基因或臨床測(cè)試來排除遺傳性腫瘤易感性綜合征。

《人體基因序列變化與疾病表征》中縮寫字母的文字解釋