【佳學(xué)基因檢測(cè)】基因解碼基因檢測(cè)元數(shù)據(jù)庫(kù)列表

元數(shù)據(jù)庫(kù)主要是通過(guò)分析關(guān)于數(shù)據(jù)的特性而生成的新數(shù)據(jù)庫(kù)。這類數(shù)據(jù)庫(kù)可以從多種來(lái)源收集數(shù)據(jù)，然后以便于大家閱讀理解的方式呈現(xiàn)出來(lái)。這種類數(shù)據(jù)庫(kù)主要提供關(guān)于疾病和物種的基因數(shù)據(jù)。
1.    BioGraph (University of Antwerp，安特衛(wèi)普大學(xué))：通過(guò)整合超過(guò)20個(gè)不同類型的數(shù)據(jù)庫(kù)，提供基于基因信息知識(shí)的服務(wù)。
2.    神經(jīng)科學(xué)信息網(wǎng)絡(luò)(Neuroscience Information Framework) (University of California, San Diego) – 整合數(shù)以百計(jì)的的神經(jīng)科學(xué)相關(guān)的資源信息。
3.    基因作用網(wǎng)格數(shù)據(jù)庫(kù)（ConsensusPathDB） - 通過(guò)整合12種數(shù)據(jù)庫(kù)，為基因解碼基因檢測(cè)提供分子相互作用分析信息。
4.    Entrez [2] (National Center for Biotechnology Information)，美國(guó)國(guó)家生物技術(shù)信息中心數(shù)據(jù)庫(kù)
5.    酵素門戶（Enzyme Portal）整合酶的信息，集聚關(guān)于小分子化學(xué)、生物化學(xué)傳導(dǎo)通路及用來(lái)調(diào)節(jié)酶活性的藥物數(shù)據(jù)庫(kù)。酶在功能營(yíng)養(yǎng)基因檢測(cè)中，又被稱為西酵素，由歐洲生物信息中心 (European Bioinformatics Institute)建立和管理。
6.    真基因數(shù)據(jù)庫(kù)（euGenes） (Indiana University)
7.    基因卡片（GeneCards） (Weizmann Inst.)
8.    基因組聚集數(shù)據(jù)庫(kù)（Genome Aggregation Database ，gnomAD) (Broad Institute)
9.    元基數(shù)據(jù)庫(kù)（MetaBase） (KOBIC) – 由用戶分享構(gòu)成的生物數(shù)據(jù)庫(kù)。
10. mGen 由世界上賊大的四個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)組成，它們是GenBank, Refseq, EMBL 和DDBJ 。數(shù)據(jù)為提取界面友好，容易使用。
11. MOPED 由西雅圖兒童研究所(Seattle Children's Research Institute)建立和管理,是一個(gè)多組學(xué)表達(dá)譜數(shù)據(jù)庫(kù),提供蛋白質(zhì)組學(xué),轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù),涵蓋人，鼠、蠕蟲(chóng)、酵母等特種。
12. 病源門戶（PathogenPortal），數(shù)據(jù)庫(kù)與由美國(guó)過(guò)敏和感染性疾病研究所建立營(yíng)運(yùn)的生物信息中心鏈接。 A repository linking to the Bioinformatics Resource Centers (BRCs) sponsored by the National Institute of Allergy and Infectious Diseases (NIAID)

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類型	數(shù)據(jù)庫(kù)資源	數(shù)據(jù)庫(kù)類型	網(wǎng)址
基因組	癌癥基因組計(jì)劃（Sanger 中心）	癌癥基因調(diào)查統(tǒng)計(jì)、體細(xì)胞突變、失雜合圖譜、缺失圖譜、小的基因內(nèi)體細(xì)胞突變	http://www.sanger.ac.uk/genetics/CGP
	美國(guó)人類基因組資源（NCBI）	人類基因組數(shù)據(jù)的整合信息資源	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/guide/human
	Genome Browser（加州大學(xué)圣克魯茲分校）	可視化和查詢工具	http://genome.ucsc.edu
核型	癌癥染色體（NCBI）	SKY/M-FISH and CGH數(shù)據(jù)庫(kù)、Mitelman數(shù)據(jù)庫(kù)、癌癥NCI周期性畸變	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?db=cancerchromosomes
核型	Progenetix（佛羅里達(dá)大學(xué)）	不同癌癥類型的CGH 數(shù)據(jù)庫(kù)	http://www.progenetix.net
單核苷酸多態(tài)性	NCBI的單核苷酸多態(tài)性數(shù)據(jù)庫(kù)	單核苷酸多態(tài)性	http://www.ncbi.nlm.nih.govprojects/SNP
單核苷酸多態(tài)性	SNP500cancer（NCBI）	癌癥流行病學(xué)有關(guān)的單核苷酸多態(tài)性	http://snp500cancer.nci.nih.gov
基因表達(dá)	NCBI的基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)	基因表達(dá)數(shù)據(jù)庫(kù)瀏覽、搜索和數(shù)據(jù)檢索的策劃資源	http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo
	Oncomine（美國(guó)密歇根大學(xué)）	定位、搜索和可視化某種基因或癌癥類型的工具	http://141.214.6.50/oncomine/main/index.jsp
	癌腫基因組解剖計(jì)（CGAP）	基因、染色體畸變、SNP 500cancer、組織、SAGE表達(dá)材料（正常的、癌癥前期生物和癌細(xì)胞的）整合資源	http://cgap.nci.nih.gov
臨床基因組	癌癥的分子水平分析計(jì)劃（CMAP）	分子表達(dá)譜、靶標(biāo)、靶向藥物和測(cè)試	http://cmap.nci.nih.gov

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